Protein–RNA interactions for Protein: Q5U452

Trp53rka, MCG14616, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trp53rkaQ5U452 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trp53rkaQ5U452 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trp53rkaQ5U452 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trp53rkaQ5U452 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Trp53rkaQ5U452 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trp53rkaQ5U452 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trp53rkaQ5U452 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trp53rkaQ5U452 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trp53rkaQ5U452 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trp53rkaQ5U452 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trp53rkaQ5U452 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trp53rkaQ5U452 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trp53rkaQ5U452 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trp53rkaQ5U452 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trp53rkaQ5U452 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trp53rkaQ5U452 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trp53rkaQ5U452 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trp53rkaQ5U452 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trp53rkaQ5U452 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trp53rkaQ5U452 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trp53rkaQ5U452 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trp53rkaQ5U452 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trp53rkaQ5U452 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trp53rkaQ5U452 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trp53rkaQ5U452 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trp53rkaQ5U452 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trp53rkaQ5U452 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trp53rkaQ5U452 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trp53rkaQ5U452 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trp53rkaQ5U452 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trp53rkaQ5U452 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trp53rkaQ5U452 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trp53rkaQ5U452 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trp53rkaQ5U452 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trp53rkaQ5U452 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trp53rkaQ5U452 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trp53rkaQ5U452 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trp53rkaQ5U452 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trp53rkaQ5U452 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trp53rkaQ5U452 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trp53rkaQ5U452 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trp53rkaQ5U452 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trp53rkaQ5U452 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Trp53rkaQ5U452 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trp53rkaQ5U452 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trp53rkaQ5U452 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trp53rkaQ5U452 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trp53rkaQ5U452 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trp53rkaQ5U452 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trp53rkaQ5U452 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trp53rkaQ5U452 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trp53rkaQ5U452 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trp53rkaQ5U452 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trp53rkaQ5U452 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trp53rkaQ5U452 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trp53rkaQ5U452 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trp53rkaQ5U452 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trp53rkaQ5U452 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trp53rkaQ5U452 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trp53rkaQ5U452 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trp53rkaQ5U452 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trp53rkaQ5U452 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trp53rkaQ5U452 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trp53rkaQ5U452 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trp53rkaQ5U452 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trp53rkaQ5U452 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trp53rkaQ5U452 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trp53rkaQ5U452 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trp53rkaQ5U452 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trp53rkaQ5U452 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trp53rkaQ5U452 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trp53rkaQ5U452 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trp53rkaQ5U452 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trp53rkaQ5U452 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trp53rkaQ5U452 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Trp53rkaQ5U452 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trp53rkaQ5U452 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trp53rkaQ5U452 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trp53rkaQ5U452 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trp53rkaQ5U452 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trp53rkaQ5U452 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trp53rkaQ5U452 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trp53rkaQ5U452 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trp53rkaQ5U452 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trp53rkaQ5U452 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trp53rkaQ5U452 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trp53rkaQ5U452 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trp53rkaQ5U452 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trp53rkaQ5U452 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trp53rkaQ5U452 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trp53rkaQ5U452 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trp53rkaQ5U452 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trp53rkaQ5U452 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trp53rkaQ5U452 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trp53rkaQ5U452 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trp53rkaQ5U452 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trp53rkaQ5U452 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trp53rkaQ5U452 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trp53rkaQ5U452 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trp53rkaQ5U452 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 173.9 ms