Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRD0

WASHC2D, WASH complex subunit 2D, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WASHC2DQ5SRD0 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
WASHC2DQ5SRD0 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
WASHC2DQ5SRD0 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
WASHC2DQ5SRD0 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
WASHC2DQ5SRD0 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
WASHC2DQ5SRD0 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
WASHC2DQ5SRD0 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
WASHC2DQ5SRD0 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
WASHC2DQ5SRD0 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
WASHC2DQ5SRD0 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
WASHC2DQ5SRD0 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
WASHC2DQ5SRD0 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
WASHC2DQ5SRD0 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
WASHC2DQ5SRD0 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
WASHC2DQ5SRD0 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
WASHC2DQ5SRD0 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
WASHC2DQ5SRD0 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
WASHC2DQ5SRD0 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
WASHC2DQ5SRD0 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
WASHC2DQ5SRD0 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
WASHC2DQ5SRD0 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
WASHC2DQ5SRD0 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
WASHC2DQ5SRD0 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
WASHC2DQ5SRD0 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
WASHC2DQ5SRD0 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
WASHC2DQ5SRD0 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
WASHC2DQ5SRD0 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
WASHC2DQ5SRD0 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
WASHC2DQ5SRD0 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
WASHC2DQ5SRD0 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
WASHC2DQ5SRD0 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
WASHC2DQ5SRD0 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
WASHC2DQ5SRD0 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
WASHC2DQ5SRD0 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
WASHC2DQ5SRD0 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
WASHC2DQ5SRD0 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
WASHC2DQ5SRD0 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
WASHC2DQ5SRD0 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
WASHC2DQ5SRD0 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
WASHC2DQ5SRD0 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
WASHC2DQ5SRD0 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
WASHC2DQ5SRD0 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
WASHC2DQ5SRD0 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
WASHC2DQ5SRD0 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
WASHC2DQ5SRD0 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
WASHC2DQ5SRD0 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
WASHC2DQ5SRD0 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
WASHC2DQ5SRD0 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
WASHC2DQ5SRD0 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
WASHC2DQ5SRD0 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
WASHC2DQ5SRD0 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
WASHC2DQ5SRD0 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
WASHC2DQ5SRD0 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
WASHC2DQ5SRD0 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
WASHC2DQ5SRD0 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
WASHC2DQ5SRD0 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
WASHC2DQ5SRD0 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
WASHC2DQ5SRD0 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
WASHC2DQ5SRD0 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
WASHC2DQ5SRD0 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
WASHC2DQ5SRD0 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
WASHC2DQ5SRD0 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
WASHC2DQ5SRD0 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
WASHC2DQ5SRD0 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
WASHC2DQ5SRD0 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
WASHC2DQ5SRD0 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
WASHC2DQ5SRD0 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
WASHC2DQ5SRD0 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
WASHC2DQ5SRD0 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
WASHC2DQ5SRD0 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
WASHC2DQ5SRD0 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
WASHC2DQ5SRD0 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
WASHC2DQ5SRD0 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
WASHC2DQ5SRD0 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
WASHC2DQ5SRD0 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
WASHC2DQ5SRD0 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
WASHC2DQ5SRD0 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
WASHC2DQ5SRD0 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
WASHC2DQ5SRD0 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
WASHC2DQ5SRD0 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
WASHC2DQ5SRD0 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
WASHC2DQ5SRD0 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
WASHC2DQ5SRD0 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
WASHC2DQ5SRD0 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
WASHC2DQ5SRD0 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
WASHC2DQ5SRD0 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
WASHC2DQ5SRD0 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
WASHC2DQ5SRD0 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
WASHC2DQ5SRD0 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
WASHC2DQ5SRD0 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
WASHC2DQ5SRD0 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
WASHC2DQ5SRD0 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
WASHC2DQ5SRD0 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
WASHC2DQ5SRD0 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
WASHC2DQ5SRD0 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
WASHC2DQ5SRD0 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
WASHC2DQ5SRD0 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
WASHC2DQ5SRD0 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
WASHC2DQ5SRD0 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
WASHC2DQ5SRD0 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms