Protein–RNA interactions for Protein: Q5SP45

5730522E02Rik, RIKEN cDNA 5730522E02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5730522E02RikQ5SP45 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
5730522E02RikQ5SP45 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
5730522E02RikQ5SP45 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
5730522E02RikQ5SP45 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
5730522E02RikQ5SP45 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
5730522E02RikQ5SP45 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
5730522E02RikQ5SP45 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
5730522E02RikQ5SP45 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
5730522E02RikQ5SP45 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
5730522E02RikQ5SP45 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
5730522E02RikQ5SP45 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
5730522E02RikQ5SP45 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
5730522E02RikQ5SP45 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
5730522E02RikQ5SP45 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
5730522E02RikQ5SP45 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
5730522E02RikQ5SP45 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
5730522E02RikQ5SP45 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
5730522E02RikQ5SP45 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
5730522E02RikQ5SP45 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
5730522E02RikQ5SP45 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
5730522E02RikQ5SP45 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
5730522E02RikQ5SP45 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
5730522E02RikQ5SP45 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
5730522E02RikQ5SP45 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
5730522E02RikQ5SP45 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
5730522E02RikQ5SP45 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
5730522E02RikQ5SP45 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
5730522E02RikQ5SP45 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
5730522E02RikQ5SP45 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
5730522E02RikQ5SP45 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
5730522E02RikQ5SP45 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
5730522E02RikQ5SP45 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
5730522E02RikQ5SP45 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
5730522E02RikQ5SP45 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
5730522E02RikQ5SP45 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
5730522E02RikQ5SP45 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
5730522E02RikQ5SP45 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
5730522E02RikQ5SP45 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
5730522E02RikQ5SP45 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
5730522E02RikQ5SP45 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
5730522E02RikQ5SP45 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
5730522E02RikQ5SP45 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
5730522E02RikQ5SP45 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
5730522E02RikQ5SP45 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
5730522E02RikQ5SP45 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
5730522E02RikQ5SP45 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
5730522E02RikQ5SP45 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
5730522E02RikQ5SP45 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
5730522E02RikQ5SP45 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
5730522E02RikQ5SP45 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
5730522E02RikQ5SP45 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
5730522E02RikQ5SP45 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
5730522E02RikQ5SP45 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
5730522E02RikQ5SP45 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
5730522E02RikQ5SP45 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
5730522E02RikQ5SP45 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
5730522E02RikQ5SP45 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
5730522E02RikQ5SP45 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
5730522E02RikQ5SP45 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
5730522E02RikQ5SP45 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
5730522E02RikQ5SP45 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
5730522E02RikQ5SP45 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
5730522E02RikQ5SP45 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
5730522E02RikQ5SP45 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
5730522E02RikQ5SP45 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
5730522E02RikQ5SP45 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
5730522E02RikQ5SP45 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
5730522E02RikQ5SP45 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
5730522E02RikQ5SP45 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
5730522E02RikQ5SP45 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
5730522E02RikQ5SP45 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
5730522E02RikQ5SP45 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
5730522E02RikQ5SP45 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
5730522E02RikQ5SP45 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
5730522E02RikQ5SP45 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
5730522E02RikQ5SP45 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
5730522E02RikQ5SP45 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
5730522E02RikQ5SP45 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
5730522E02RikQ5SP45 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
5730522E02RikQ5SP45 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
5730522E02RikQ5SP45 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
5730522E02RikQ5SP45 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
5730522E02RikQ5SP45 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
5730522E02RikQ5SP45 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
5730522E02RikQ5SP45 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
5730522E02RikQ5SP45 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
5730522E02RikQ5SP45 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
5730522E02RikQ5SP45 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
5730522E02RikQ5SP45 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
5730522E02RikQ5SP45 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
5730522E02RikQ5SP45 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
5730522E02RikQ5SP45 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
5730522E02RikQ5SP45 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
5730522E02RikQ5SP45 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
5730522E02RikQ5SP45 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
5730522E02RikQ5SP45 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
5730522E02RikQ5SP45 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
5730522E02RikQ5SP45 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
5730522E02RikQ5SP45 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
5730522E02RikQ5SP45 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.9 ms