Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT4

Rtl5, Retrotransposon Gag-like protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl5Q5DTT4 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Rtl5Q5DTT4 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Rtl5Q5DTT4 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Rtl5Q5DTT4 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Rtl5Q5DTT4 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Rtl5Q5DTT4 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Rtl5Q5DTT4 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Rtl5Q5DTT4 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Rtl5Q5DTT4 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Rtl5Q5DTT4 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Rtl5Q5DTT4 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Rtl5Q5DTT4 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Rtl5Q5DTT4 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Rtl5Q5DTT4 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Rtl5Q5DTT4 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Rtl5Q5DTT4 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Rtl5Q5DTT4 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Rtl5Q5DTT4 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Rtl5Q5DTT4 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Rtl5Q5DTT4 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Rtl5Q5DTT4 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Rtl5Q5DTT4 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Rtl5Q5DTT4 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Rtl5Q5DTT4 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Rtl5Q5DTT4 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Rtl5Q5DTT4 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Rtl5Q5DTT4 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Rtl5Q5DTT4 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Rtl5Q5DTT4 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Rtl5Q5DTT4 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Rtl5Q5DTT4 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Rtl5Q5DTT4 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Rtl5Q5DTT4 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Rtl5Q5DTT4 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Rtl5Q5DTT4 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Rtl5Q5DTT4 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Rtl5Q5DTT4 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Rtl5Q5DTT4 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Rtl5Q5DTT4 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Rtl5Q5DTT4 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Rtl5Q5DTT4 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Rtl5Q5DTT4 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Rtl5Q5DTT4 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Rtl5Q5DTT4 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Rtl5Q5DTT4 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Rtl5Q5DTT4 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Rtl5Q5DTT4 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Rtl5Q5DTT4 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Rtl5Q5DTT4 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Rtl5Q5DTT4 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Rtl5Q5DTT4 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Rtl5Q5DTT4 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Rtl5Q5DTT4 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Rtl5Q5DTT4 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Rtl5Q5DTT4 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Rtl5Q5DTT4 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Rtl5Q5DTT4 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Rtl5Q5DTT4 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Rtl5Q5DTT4 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Rtl5Q5DTT4 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Rtl5Q5DTT4 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Rtl5Q5DTT4 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Rtl5Q5DTT4 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Rtl5Q5DTT4 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Rtl5Q5DTT4 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
Rtl5Q5DTT4 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
Rtl5Q5DTT4 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Rtl5Q5DTT4 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Rtl5Q5DTT4 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Rtl5Q5DTT4 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Rtl5Q5DTT4 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Rtl5Q5DTT4 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Rtl5Q5DTT4 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Rtl5Q5DTT4 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Rtl5Q5DTT4 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Rtl5Q5DTT4 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Rtl5Q5DTT4 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Rtl5Q5DTT4 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Rtl5Q5DTT4 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Rtl5Q5DTT4 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Rtl5Q5DTT4 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Rtl5Q5DTT4 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Rtl5Q5DTT4 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Rtl5Q5DTT4 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Rtl5Q5DTT4 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Rtl5Q5DTT4 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Rtl5Q5DTT4 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Rtl5Q5DTT4 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Rtl5Q5DTT4 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Rtl5Q5DTT4 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Rtl5Q5DTT4 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Rtl5Q5DTT4 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Rtl5Q5DTT4 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Rtl5Q5DTT4 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Rtl5Q5DTT4 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Rtl5Q5DTT4 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Rtl5Q5DTT4 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Rtl5Q5DTT4 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Rtl5Q5DTT4 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Rtl5Q5DTT4 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms