Protein–RNA interactions for Protein: Q571F5

Spsb3, SPRY domain-containing SOCS box protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spsb3Q571F5 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Spsb3Q571F5 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Spsb3Q571F5 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Spsb3Q571F5 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Spsb3Q571F5 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Spsb3Q571F5 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Spsb3Q571F5 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Spsb3Q571F5 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Spsb3Q571F5 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Spsb3Q571F5 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Spsb3Q571F5 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Spsb3Q571F5 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Spsb3Q571F5 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Spsb3Q571F5 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Spsb3Q571F5 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Spsb3Q571F5 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Spsb3Q571F5 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Spsb3Q571F5 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Spsb3Q571F5 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Spsb3Q571F5 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Spsb3Q571F5 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Spsb3Q571F5 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Spsb3Q571F5 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Spsb3Q571F5 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Spsb3Q571F5 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Spsb3Q571F5 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Spsb3Q571F5 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Spsb3Q571F5 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Spsb3Q571F5 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Spsb3Q571F5 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Spsb3Q571F5 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Spsb3Q571F5 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Spsb3Q571F5 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Spsb3Q571F5 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Spsb3Q571F5 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Spsb3Q571F5 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Spsb3Q571F5 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Spsb3Q571F5 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Spsb3Q571F5 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Spsb3Q571F5 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Spsb3Q571F5 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Spsb3Q571F5 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Spsb3Q571F5 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Spsb3Q571F5 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Spsb3Q571F5 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Spsb3Q571F5 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Spsb3Q571F5 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Spsb3Q571F5 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Spsb3Q571F5 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Spsb3Q571F5 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Spsb3Q571F5 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Spsb3Q571F5 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Spsb3Q571F5 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Spsb3Q571F5 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Spsb3Q571F5 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Spsb3Q571F5 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Spsb3Q571F5 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Spsb3Q571F5 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Spsb3Q571F5 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Spsb3Q571F5 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Spsb3Q571F5 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Spsb3Q571F5 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Spsb3Q571F5 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Spsb3Q571F5 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Spsb3Q571F5 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Spsb3Q571F5 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Spsb3Q571F5 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Spsb3Q571F5 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Spsb3Q571F5 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Spsb3Q571F5 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Spsb3Q571F5 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Spsb3Q571F5 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Spsb3Q571F5 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Spsb3Q571F5 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Spsb3Q571F5 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Spsb3Q571F5 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Spsb3Q571F5 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Spsb3Q571F5 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Spsb3Q571F5 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Spsb3Q571F5 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Spsb3Q571F5 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Spsb3Q571F5 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Spsb3Q571F5 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Spsb3Q571F5 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Spsb3Q571F5 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Spsb3Q571F5 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Spsb3Q571F5 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Spsb3Q571F5 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Spsb3Q571F5 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Spsb3Q571F5 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Spsb3Q571F5 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Spsb3Q571F5 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Spsb3Q571F5 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Spsb3Q571F5 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Spsb3Q571F5 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Spsb3Q571F5 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Spsb3Q571F5 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Spsb3Q571F5 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Spsb3Q571F5 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Spsb3Q571F5 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms