Protein–RNA interactions for Protein: Q4FZC9

Syne3, Nesprin-3, mousemouse

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Length 975 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syne3Q4FZC9 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Syne3Q4FZC9 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Syne3Q4FZC9 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Syne3Q4FZC9 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Syne3Q4FZC9 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Syne3Q4FZC9 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Syne3Q4FZC9 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Syne3Q4FZC9 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Syne3Q4FZC9 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Syne3Q4FZC9 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Syne3Q4FZC9 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Syne3Q4FZC9 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Syne3Q4FZC9 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Syne3Q4FZC9 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Syne3Q4FZC9 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Syne3Q4FZC9 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Syne3Q4FZC9 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Syne3Q4FZC9 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Syne3Q4FZC9 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Syne3Q4FZC9 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Syne3Q4FZC9 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Syne3Q4FZC9 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Syne3Q4FZC9 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Syne3Q4FZC9 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Syne3Q4FZC9 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Syne3Q4FZC9 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Syne3Q4FZC9 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Syne3Q4FZC9 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Syne3Q4FZC9 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Syne3Q4FZC9 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Syne3Q4FZC9 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Syne3Q4FZC9 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Syne3Q4FZC9 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Syne3Q4FZC9 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Syne3Q4FZC9 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Syne3Q4FZC9 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Syne3Q4FZC9 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Syne3Q4FZC9 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Syne3Q4FZC9 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Syne3Q4FZC9 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Syne3Q4FZC9 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Syne3Q4FZC9 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Syne3Q4FZC9 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Syne3Q4FZC9 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Syne3Q4FZC9 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Syne3Q4FZC9 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Syne3Q4FZC9 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Syne3Q4FZC9 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Syne3Q4FZC9 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Syne3Q4FZC9 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Syne3Q4FZC9 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Syne3Q4FZC9 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Syne3Q4FZC9 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Syne3Q4FZC9 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Syne3Q4FZC9 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Syne3Q4FZC9 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Syne3Q4FZC9 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Syne3Q4FZC9 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Syne3Q4FZC9 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Syne3Q4FZC9 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Syne3Q4FZC9 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Syne3Q4FZC9 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Syne3Q4FZC9 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Syne3Q4FZC9 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Syne3Q4FZC9 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Syne3Q4FZC9 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Syne3Q4FZC9 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Syne3Q4FZC9 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Syne3Q4FZC9 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Syne3Q4FZC9 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Syne3Q4FZC9 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Syne3Q4FZC9 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Syne3Q4FZC9 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Syne3Q4FZC9 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Syne3Q4FZC9 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Syne3Q4FZC9 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Syne3Q4FZC9 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Syne3Q4FZC9 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Syne3Q4FZC9 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Syne3Q4FZC9 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Syne3Q4FZC9 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Syne3Q4FZC9 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Syne3Q4FZC9 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Syne3Q4FZC9 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Syne3Q4FZC9 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Syne3Q4FZC9 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Syne3Q4FZC9 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Syne3Q4FZC9 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Syne3Q4FZC9 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Syne3Q4FZC9 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Syne3Q4FZC9 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Syne3Q4FZC9 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Syne3Q4FZC9 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Syne3Q4FZC9 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Syne3Q4FZC9 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Syne3Q4FZC9 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Syne3Q4FZC9 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Syne3Q4FZC9 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Syne3Q4FZC9 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Syne3Q4FZC9 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
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