Protein–RNA interactions for Protein: Q3V3V9

Carmil2, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Carmil2Q3V3V9 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Carmil2Q3V3V9 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Carmil2Q3V3V9 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Carmil2Q3V3V9 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Carmil2Q3V3V9 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Carmil2Q3V3V9 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Carmil2Q3V3V9 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Carmil2Q3V3V9 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Carmil2Q3V3V9 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Carmil2Q3V3V9 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Carmil2Q3V3V9 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Carmil2Q3V3V9 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Carmil2Q3V3V9 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Carmil2Q3V3V9 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Carmil2Q3V3V9 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Carmil2Q3V3V9 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Carmil2Q3V3V9 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Carmil2Q3V3V9 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Carmil2Q3V3V9 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Carmil2Q3V3V9 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Carmil2Q3V3V9 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Carmil2Q3V3V9 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Carmil2Q3V3V9 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Carmil2Q3V3V9 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Carmil2Q3V3V9 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Carmil2Q3V3V9 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Carmil2Q3V3V9 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Carmil2Q3V3V9 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Carmil2Q3V3V9 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Carmil2Q3V3V9 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Carmil2Q3V3V9 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Carmil2Q3V3V9 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Carmil2Q3V3V9 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Carmil2Q3V3V9 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Carmil2Q3V3V9 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Carmil2Q3V3V9 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Carmil2Q3V3V9 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Carmil2Q3V3V9 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Carmil2Q3V3V9 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Carmil2Q3V3V9 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Carmil2Q3V3V9 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Carmil2Q3V3V9 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Carmil2Q3V3V9 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Carmil2Q3V3V9 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Carmil2Q3V3V9 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Carmil2Q3V3V9 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Carmil2Q3V3V9 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Carmil2Q3V3V9 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Carmil2Q3V3V9 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Carmil2Q3V3V9 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Carmil2Q3V3V9 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Carmil2Q3V3V9 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Carmil2Q3V3V9 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Carmil2Q3V3V9 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Carmil2Q3V3V9 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Carmil2Q3V3V9 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Carmil2Q3V3V9 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Carmil2Q3V3V9 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Carmil2Q3V3V9 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Carmil2Q3V3V9 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Carmil2Q3V3V9 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Carmil2Q3V3V9 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Carmil2Q3V3V9 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Carmil2Q3V3V9 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Carmil2Q3V3V9 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Carmil2Q3V3V9 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Carmil2Q3V3V9 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Carmil2Q3V3V9 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Carmil2Q3V3V9 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Carmil2Q3V3V9 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Carmil2Q3V3V9 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Carmil2Q3V3V9 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Carmil2Q3V3V9 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Carmil2Q3V3V9 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Carmil2Q3V3V9 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Carmil2Q3V3V9 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Carmil2Q3V3V9 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Carmil2Q3V3V9 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Carmil2Q3V3V9 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Carmil2Q3V3V9 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Carmil2Q3V3V9 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Carmil2Q3V3V9 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Carmil2Q3V3V9 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Carmil2Q3V3V9 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Carmil2Q3V3V9 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Carmil2Q3V3V9 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Carmil2Q3V3V9 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Carmil2Q3V3V9 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Carmil2Q3V3V9 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Carmil2Q3V3V9 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Carmil2Q3V3V9 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Carmil2Q3V3V9 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Carmil2Q3V3V9 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Carmil2Q3V3V9 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Carmil2Q3V3V9 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Carmil2Q3V3V9 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Carmil2Q3V3V9 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Carmil2Q3V3V9 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Carmil2Q3V3V9 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Carmil2Q3V3V9 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms