Protein–RNA interactions for Protein: Q3V3Q7

Pacs2, Phosphofurin acidic cluster sorting protein 2, mousemouse

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Length 862 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacs2Q3V3Q7 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pacs2Q3V3Q7 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pacs2Q3V3Q7 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pacs2Q3V3Q7 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pacs2Q3V3Q7 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pacs2Q3V3Q7 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pacs2Q3V3Q7 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pacs2Q3V3Q7 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pacs2Q3V3Q7 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pacs2Q3V3Q7 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pacs2Q3V3Q7 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pacs2Q3V3Q7 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pacs2Q3V3Q7 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pacs2Q3V3Q7 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Pacs2Q3V3Q7 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pacs2Q3V3Q7 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pacs2Q3V3Q7 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pacs2Q3V3Q7 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pacs2Q3V3Q7 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pacs2Q3V3Q7 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pacs2Q3V3Q7 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pacs2Q3V3Q7 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Pacs2Q3V3Q7 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pacs2Q3V3Q7 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pacs2Q3V3Q7 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pacs2Q3V3Q7 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pacs2Q3V3Q7 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pacs2Q3V3Q7 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pacs2Q3V3Q7 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pacs2Q3V3Q7 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pacs2Q3V3Q7 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pacs2Q3V3Q7 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pacs2Q3V3Q7 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pacs2Q3V3Q7 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pacs2Q3V3Q7 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pacs2Q3V3Q7 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pacs2Q3V3Q7 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pacs2Q3V3Q7 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pacs2Q3V3Q7 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pacs2Q3V3Q7 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pacs2Q3V3Q7 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pacs2Q3V3Q7 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pacs2Q3V3Q7 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pacs2Q3V3Q7 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pacs2Q3V3Q7 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pacs2Q3V3Q7 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pacs2Q3V3Q7 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pacs2Q3V3Q7 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pacs2Q3V3Q7 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pacs2Q3V3Q7 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pacs2Q3V3Q7 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pacs2Q3V3Q7 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pacs2Q3V3Q7 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pacs2Q3V3Q7 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pacs2Q3V3Q7 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pacs2Q3V3Q7 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pacs2Q3V3Q7 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pacs2Q3V3Q7 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pacs2Q3V3Q7 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pacs2Q3V3Q7 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pacs2Q3V3Q7 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pacs2Q3V3Q7 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pacs2Q3V3Q7 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pacs2Q3V3Q7 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pacs2Q3V3Q7 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pacs2Q3V3Q7 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pacs2Q3V3Q7 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pacs2Q3V3Q7 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pacs2Q3V3Q7 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pacs2Q3V3Q7 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pacs2Q3V3Q7 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pacs2Q3V3Q7 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pacs2Q3V3Q7 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pacs2Q3V3Q7 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pacs2Q3V3Q7 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pacs2Q3V3Q7 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pacs2Q3V3Q7 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pacs2Q3V3Q7 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pacs2Q3V3Q7 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pacs2Q3V3Q7 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pacs2Q3V3Q7 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pacs2Q3V3Q7 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pacs2Q3V3Q7 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pacs2Q3V3Q7 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pacs2Q3V3Q7 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pacs2Q3V3Q7 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Pacs2Q3V3Q7 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Pacs2Q3V3Q7 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Pacs2Q3V3Q7 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Pacs2Q3V3Q7 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Pacs2Q3V3Q7 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Pacs2Q3V3Q7 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Pacs2Q3V3Q7 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Pacs2Q3V3Q7 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Pacs2Q3V3Q7 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Pacs2Q3V3Q7 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Pacs2Q3V3Q7 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Pacs2Q3V3Q7 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Pacs2Q3V3Q7 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Pacs2Q3V3Q7 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
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