Protein–RNA interactions for Protein: Q3UT53

BB287469, Expressed sequence BB287469, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BB287469Q3UT53 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BB287469Q3UT53 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BB287469Q3UT53 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BB287469Q3UT53 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BB287469Q3UT53 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BB287469Q3UT53 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BB287469Q3UT53 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BB287469Q3UT53 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BB287469Q3UT53 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BB287469Q3UT53 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BB287469Q3UT53 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BB287469Q3UT53 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BB287469Q3UT53 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BB287469Q3UT53 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BB287469Q3UT53 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BB287469Q3UT53 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
BB287469Q3UT53 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BB287469Q3UT53 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BB287469Q3UT53 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BB287469Q3UT53 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BB287469Q3UT53 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BB287469Q3UT53 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BB287469Q3UT53 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
BB287469Q3UT53 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BB287469Q3UT53 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BB287469Q3UT53 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BB287469Q3UT53 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BB287469Q3UT53 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
BB287469Q3UT53 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BB287469Q3UT53 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BB287469Q3UT53 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BB287469Q3UT53 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BB287469Q3UT53 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BB287469Q3UT53 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BB287469Q3UT53 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BB287469Q3UT53 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BB287469Q3UT53 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BB287469Q3UT53 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BB287469Q3UT53 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
BB287469Q3UT53 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
BB287469Q3UT53 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
BB287469Q3UT53 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BB287469Q3UT53 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BB287469Q3UT53 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BB287469Q3UT53 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
BB287469Q3UT53 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BB287469Q3UT53 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BB287469Q3UT53 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
BB287469Q3UT53 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BB287469Q3UT53 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BB287469Q3UT53 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BB287469Q3UT53 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BB287469Q3UT53 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BB287469Q3UT53 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BB287469Q3UT53 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BB287469Q3UT53 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BB287469Q3UT53 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BB287469Q3UT53 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BB287469Q3UT53 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BB287469Q3UT53 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BB287469Q3UT53 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BB287469Q3UT53 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BB287469Q3UT53 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BB287469Q3UT53 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BB287469Q3UT53 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BB287469Q3UT53 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BB287469Q3UT53 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BB287469Q3UT53 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BB287469Q3UT53 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BB287469Q3UT53 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
BB287469Q3UT53 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BB287469Q3UT53 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BB287469Q3UT53 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BB287469Q3UT53 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BB287469Q3UT53 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BB287469Q3UT53 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
BB287469Q3UT53 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
BB287469Q3UT53 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BB287469Q3UT53 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BB287469Q3UT53 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BB287469Q3UT53 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
BB287469Q3UT53 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BB287469Q3UT53 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BB287469Q3UT53 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BB287469Q3UT53 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
BB287469Q3UT53 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BB287469Q3UT53 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
BB287469Q3UT53 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
BB287469Q3UT53 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
BB287469Q3UT53 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
BB287469Q3UT53 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
BB287469Q3UT53 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BB287469Q3UT53 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BB287469Q3UT53 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BB287469Q3UT53 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BB287469Q3UT53 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BB287469Q3UT53 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BB287469Q3UT53 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
BB287469Q3UT53 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BB287469Q3UT53 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms