Protein–RNA interactions for Protein: Q3USH5

Sfswap, Splicing factor, suppressor of white-apricot homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 945 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SfswapQ3USH5 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SfswapQ3USH5 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SfswapQ3USH5 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SfswapQ3USH5 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SfswapQ3USH5 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SfswapQ3USH5 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SfswapQ3USH5 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SfswapQ3USH5 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SfswapQ3USH5 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SfswapQ3USH5 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SfswapQ3USH5 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SfswapQ3USH5 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SfswapQ3USH5 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SfswapQ3USH5 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SfswapQ3USH5 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SfswapQ3USH5 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SfswapQ3USH5 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SfswapQ3USH5 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SfswapQ3USH5 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SfswapQ3USH5 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SfswapQ3USH5 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SfswapQ3USH5 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SfswapQ3USH5 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SfswapQ3USH5 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SfswapQ3USH5 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SfswapQ3USH5 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SfswapQ3USH5 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SfswapQ3USH5 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SfswapQ3USH5 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SfswapQ3USH5 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SfswapQ3USH5 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SfswapQ3USH5 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SfswapQ3USH5 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SfswapQ3USH5 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SfswapQ3USH5 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SfswapQ3USH5 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SfswapQ3USH5 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SfswapQ3USH5 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SfswapQ3USH5 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SfswapQ3USH5 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SfswapQ3USH5 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SfswapQ3USH5 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SfswapQ3USH5 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SfswapQ3USH5 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SfswapQ3USH5 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SfswapQ3USH5 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SfswapQ3USH5 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SfswapQ3USH5 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SfswapQ3USH5 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SfswapQ3USH5 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SfswapQ3USH5 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SfswapQ3USH5 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SfswapQ3USH5 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SfswapQ3USH5 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SfswapQ3USH5 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SfswapQ3USH5 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SfswapQ3USH5 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SfswapQ3USH5 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SfswapQ3USH5 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SfswapQ3USH5 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SfswapQ3USH5 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SfswapQ3USH5 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SfswapQ3USH5 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SfswapQ3USH5 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SfswapQ3USH5 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SfswapQ3USH5 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SfswapQ3USH5 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SfswapQ3USH5 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SfswapQ3USH5 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SfswapQ3USH5 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SfswapQ3USH5 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SfswapQ3USH5 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SfswapQ3USH5 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SfswapQ3USH5 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SfswapQ3USH5 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SfswapQ3USH5 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SfswapQ3USH5 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SfswapQ3USH5 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SfswapQ3USH5 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SfswapQ3USH5 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SfswapQ3USH5 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SfswapQ3USH5 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SfswapQ3USH5 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SfswapQ3USH5 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SfswapQ3USH5 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SfswapQ3USH5 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SfswapQ3USH5 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SfswapQ3USH5 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SfswapQ3USH5 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SfswapQ3USH5 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SfswapQ3USH5 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SfswapQ3USH5 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SfswapQ3USH5 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SfswapQ3USH5 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SfswapQ3USH5 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SfswapQ3USH5 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SfswapQ3USH5 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SfswapQ3USH5 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SfswapQ3USH5 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SfswapQ3USH5 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms