Protein–RNA interactions for Protein: Q3URS2

Zscan4f, Zinc finger and SCAN domain containing protein 4F, mousemouse

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Length 506 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zscan4fQ3URS2 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Zscan4fQ3URS2 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Zscan4fQ3URS2 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Zscan4fQ3URS2 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Zscan4fQ3URS2 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Zscan4fQ3URS2 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Zscan4fQ3URS2 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Zscan4fQ3URS2 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Zscan4fQ3URS2 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Zscan4fQ3URS2 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Zscan4fQ3URS2 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Zscan4fQ3URS2 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Zscan4fQ3URS2 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Zscan4fQ3URS2 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Zscan4fQ3URS2 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Zscan4fQ3URS2 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Zscan4fQ3URS2 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Zscan4fQ3URS2 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Zscan4fQ3URS2 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Zscan4fQ3URS2 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Zscan4fQ3URS2 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Zscan4fQ3URS2 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Zscan4fQ3URS2 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Zscan4fQ3URS2 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Zscan4fQ3URS2 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Zscan4fQ3URS2 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Zscan4fQ3URS2 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Zscan4fQ3URS2 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Zscan4fQ3URS2 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Zscan4fQ3URS2 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Zscan4fQ3URS2 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Zscan4fQ3URS2 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Zscan4fQ3URS2 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Zscan4fQ3URS2 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Zscan4fQ3URS2 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Zscan4fQ3URS2 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Zscan4fQ3URS2 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Zscan4fQ3URS2 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Zscan4fQ3URS2 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Zscan4fQ3URS2 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Zscan4fQ3URS2 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Zscan4fQ3URS2 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Zscan4fQ3URS2 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Zscan4fQ3URS2 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Zscan4fQ3URS2 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Zscan4fQ3URS2 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Zscan4fQ3URS2 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Zscan4fQ3URS2 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Zscan4fQ3URS2 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Zscan4fQ3URS2 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Zscan4fQ3URS2 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Zscan4fQ3URS2 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Zscan4fQ3URS2 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Zscan4fQ3URS2 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Zscan4fQ3URS2 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Zscan4fQ3URS2 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Zscan4fQ3URS2 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Zscan4fQ3URS2 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Zscan4fQ3URS2 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Zscan4fQ3URS2 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Zscan4fQ3URS2 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Zscan4fQ3URS2 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Zscan4fQ3URS2 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Zscan4fQ3URS2 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Zscan4fQ3URS2 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Zscan4fQ3URS2 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Zscan4fQ3URS2 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Zscan4fQ3URS2 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Zscan4fQ3URS2 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Zscan4fQ3URS2 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Zscan4fQ3URS2 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Zscan4fQ3URS2 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Zscan4fQ3URS2 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Zscan4fQ3URS2 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Zscan4fQ3URS2 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Zscan4fQ3URS2 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Zscan4fQ3URS2 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Zscan4fQ3URS2 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Zscan4fQ3URS2 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Zscan4fQ3URS2 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Zscan4fQ3URS2 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Zscan4fQ3URS2 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Zscan4fQ3URS2 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Zscan4fQ3URS2 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Zscan4fQ3URS2 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Zscan4fQ3URS2 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Zscan4fQ3URS2 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Zscan4fQ3URS2 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Zscan4fQ3URS2 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Zscan4fQ3URS2 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Zscan4fQ3URS2 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Zscan4fQ3URS2 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Zscan4fQ3URS2 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Zscan4fQ3URS2 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Zscan4fQ3URS2 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Zscan4fQ3URS2 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Zscan4fQ3URS2 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Zscan4fQ3URS2 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Zscan4fQ3URS2 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Zscan4fQ3URS2 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms