Protein–RNA interactions for Protein: Q3UAW9

Brf2, Transcription factor IIIB 50 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brf2Q3UAW9 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Brf2Q3UAW9 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Brf2Q3UAW9 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Brf2Q3UAW9 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Brf2Q3UAW9 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Brf2Q3UAW9 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Brf2Q3UAW9 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Brf2Q3UAW9 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Brf2Q3UAW9 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Brf2Q3UAW9 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Brf2Q3UAW9 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Brf2Q3UAW9 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Brf2Q3UAW9 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Brf2Q3UAW9 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Brf2Q3UAW9 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Brf2Q3UAW9 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Brf2Q3UAW9 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Brf2Q3UAW9 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Brf2Q3UAW9 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Brf2Q3UAW9 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Brf2Q3UAW9 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Brf2Q3UAW9 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Brf2Q3UAW9 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Brf2Q3UAW9 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Brf2Q3UAW9 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Brf2Q3UAW9 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Brf2Q3UAW9 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Brf2Q3UAW9 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Brf2Q3UAW9 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Brf2Q3UAW9 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Brf2Q3UAW9 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Brf2Q3UAW9 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Brf2Q3UAW9 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Brf2Q3UAW9 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Brf2Q3UAW9 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Brf2Q3UAW9 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Brf2Q3UAW9 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Brf2Q3UAW9 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Brf2Q3UAW9 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Brf2Q3UAW9 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Brf2Q3UAW9 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Brf2Q3UAW9 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Brf2Q3UAW9 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Brf2Q3UAW9 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Brf2Q3UAW9 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Brf2Q3UAW9 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Brf2Q3UAW9 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Brf2Q3UAW9 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Brf2Q3UAW9 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Brf2Q3UAW9 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Brf2Q3UAW9 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Brf2Q3UAW9 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Brf2Q3UAW9 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Brf2Q3UAW9 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Brf2Q3UAW9 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Brf2Q3UAW9 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Brf2Q3UAW9 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Brf2Q3UAW9 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Brf2Q3UAW9 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Brf2Q3UAW9 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Brf2Q3UAW9 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Brf2Q3UAW9 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Brf2Q3UAW9 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Brf2Q3UAW9 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Brf2Q3UAW9 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Brf2Q3UAW9 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Brf2Q3UAW9 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Brf2Q3UAW9 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Brf2Q3UAW9 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Brf2Q3UAW9 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Brf2Q3UAW9 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Brf2Q3UAW9 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Brf2Q3UAW9 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Brf2Q3UAW9 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Brf2Q3UAW9 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Brf2Q3UAW9 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Brf2Q3UAW9 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Brf2Q3UAW9 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Brf2Q3UAW9 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Brf2Q3UAW9 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Brf2Q3UAW9 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Brf2Q3UAW9 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Brf2Q3UAW9 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Brf2Q3UAW9 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Brf2Q3UAW9 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Brf2Q3UAW9 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Brf2Q3UAW9 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Brf2Q3UAW9 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Brf2Q3UAW9 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Brf2Q3UAW9 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Brf2Q3UAW9 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Brf2Q3UAW9 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Brf2Q3UAW9 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Brf2Q3UAW9 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Brf2Q3UAW9 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Brf2Q3UAW9 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Brf2Q3UAW9 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Brf2Q3UAW9 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Brf2Q3UAW9 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Brf2Q3UAW9 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms