Protein–RNA interactions for Protein: Q3THK3

Gtf2f1, General transcription factor IIF subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2f1Q3THK3 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gtf2f1Q3THK3 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gtf2f1Q3THK3 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gtf2f1Q3THK3 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Gtf2f1Q3THK3 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gtf2f1Q3THK3 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gtf2f1Q3THK3 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gtf2f1Q3THK3 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
Gtf2f1Q3THK3 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gtf2f1Q3THK3 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gtf2f1Q3THK3 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Gtf2f1Q3THK3 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gtf2f1Q3THK3 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gtf2f1Q3THK3 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gtf2f1Q3THK3 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gtf2f1Q3THK3 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Gtf2f1Q3THK3 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gtf2f1Q3THK3 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gtf2f1Q3THK3 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gtf2f1Q3THK3 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gtf2f1Q3THK3 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gtf2f1Q3THK3 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Gtf2f1Q3THK3 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gtf2f1Q3THK3 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gtf2f1Q3THK3 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gtf2f1Q3THK3 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gtf2f1Q3THK3 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gtf2f1Q3THK3 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gtf2f1Q3THK3 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gtf2f1Q3THK3 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gtf2f1Q3THK3 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gtf2f1Q3THK3 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gtf2f1Q3THK3 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gtf2f1Q3THK3 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gtf2f1Q3THK3 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gtf2f1Q3THK3 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gtf2f1Q3THK3 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gtf2f1Q3THK3 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gtf2f1Q3THK3 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Gtf2f1Q3THK3 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gtf2f1Q3THK3 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gtf2f1Q3THK3 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gtf2f1Q3THK3 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gtf2f1Q3THK3 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Gtf2f1Q3THK3 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gtf2f1Q3THK3 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gtf2f1Q3THK3 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gtf2f1Q3THK3 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Gtf2f1Q3THK3 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gtf2f1Q3THK3 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gtf2f1Q3THK3 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gtf2f1Q3THK3 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gtf2f1Q3THK3 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gtf2f1Q3THK3 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gtf2f1Q3THK3 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gtf2f1Q3THK3 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gtf2f1Q3THK3 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gtf2f1Q3THK3 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gtf2f1Q3THK3 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gtf2f1Q3THK3 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gtf2f1Q3THK3 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gtf2f1Q3THK3 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gtf2f1Q3THK3 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gtf2f1Q3THK3 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gtf2f1Q3THK3 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gtf2f1Q3THK3 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gtf2f1Q3THK3 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gtf2f1Q3THK3 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gtf2f1Q3THK3 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gtf2f1Q3THK3 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gtf2f1Q3THK3 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gtf2f1Q3THK3 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gtf2f1Q3THK3 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gtf2f1Q3THK3 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gtf2f1Q3THK3 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gtf2f1Q3THK3 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gtf2f1Q3THK3 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gtf2f1Q3THK3 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gtf2f1Q3THK3 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Gtf2f1Q3THK3 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gtf2f1Q3THK3 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gtf2f1Q3THK3 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gtf2f1Q3THK3 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gtf2f1Q3THK3 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gtf2f1Q3THK3 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gtf2f1Q3THK3 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gtf2f1Q3THK3 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gtf2f1Q3THK3 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gtf2f1Q3THK3 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gtf2f1Q3THK3 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gtf2f1Q3THK3 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gtf2f1Q3THK3 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gtf2f1Q3THK3 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gtf2f1Q3THK3 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gtf2f1Q3THK3 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Gtf2f1Q3THK3 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gtf2f1Q3THK3 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gtf2f1Q3THK3 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gtf2f1Q3THK3 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gtf2f1Q3THK3 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 101.2 ms