Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYK4

Vrtn, Vertnin, mousemouse

Predictions only

Length 740 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VrtnQ3SYK4 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
VrtnQ3SYK4 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
VrtnQ3SYK4 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
VrtnQ3SYK4 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
VrtnQ3SYK4 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
VrtnQ3SYK4 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
VrtnQ3SYK4 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
VrtnQ3SYK4 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
VrtnQ3SYK4 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
VrtnQ3SYK4 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
VrtnQ3SYK4 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
VrtnQ3SYK4 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
VrtnQ3SYK4 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
VrtnQ3SYK4 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
VrtnQ3SYK4 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
VrtnQ3SYK4 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
VrtnQ3SYK4 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
VrtnQ3SYK4 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
VrtnQ3SYK4 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
VrtnQ3SYK4 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
VrtnQ3SYK4 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
VrtnQ3SYK4 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
VrtnQ3SYK4 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
VrtnQ3SYK4 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
VrtnQ3SYK4 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
VrtnQ3SYK4 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
VrtnQ3SYK4 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
VrtnQ3SYK4 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
VrtnQ3SYK4 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
VrtnQ3SYK4 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
VrtnQ3SYK4 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
VrtnQ3SYK4 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
VrtnQ3SYK4 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
VrtnQ3SYK4 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
VrtnQ3SYK4 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
VrtnQ3SYK4 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
VrtnQ3SYK4 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
VrtnQ3SYK4 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
VrtnQ3SYK4 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
VrtnQ3SYK4 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
VrtnQ3SYK4 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
VrtnQ3SYK4 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
VrtnQ3SYK4 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
VrtnQ3SYK4 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
VrtnQ3SYK4 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
VrtnQ3SYK4 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
VrtnQ3SYK4 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
VrtnQ3SYK4 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
VrtnQ3SYK4 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
VrtnQ3SYK4 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
VrtnQ3SYK4 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
VrtnQ3SYK4 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
VrtnQ3SYK4 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
VrtnQ3SYK4 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
VrtnQ3SYK4 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
VrtnQ3SYK4 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
VrtnQ3SYK4 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
VrtnQ3SYK4 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
VrtnQ3SYK4 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
VrtnQ3SYK4 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
VrtnQ3SYK4 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
VrtnQ3SYK4 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
VrtnQ3SYK4 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
VrtnQ3SYK4 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
VrtnQ3SYK4 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
VrtnQ3SYK4 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
VrtnQ3SYK4 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
VrtnQ3SYK4 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
VrtnQ3SYK4 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
VrtnQ3SYK4 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
VrtnQ3SYK4 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
VrtnQ3SYK4 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
VrtnQ3SYK4 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
VrtnQ3SYK4 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
VrtnQ3SYK4 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
VrtnQ3SYK4 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
VrtnQ3SYK4 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
VrtnQ3SYK4 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
VrtnQ3SYK4 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
VrtnQ3SYK4 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
VrtnQ3SYK4 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
VrtnQ3SYK4 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
VrtnQ3SYK4 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
VrtnQ3SYK4 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
VrtnQ3SYK4 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
VrtnQ3SYK4 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
VrtnQ3SYK4 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
VrtnQ3SYK4 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
VrtnQ3SYK4 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
VrtnQ3SYK4 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
VrtnQ3SYK4 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
VrtnQ3SYK4 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
VrtnQ3SYK4 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
VrtnQ3SYK4 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
VrtnQ3SYK4 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
VrtnQ3SYK4 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
VrtnQ3SYK4 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
VrtnQ3SYK4 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
VrtnQ3SYK4 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
VrtnQ3SYK4 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms