Protein–RNA interactions for Protein: Q3B7T1

EDRF1, Erythroid differentiation-related factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDRF1Q3B7T1 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
EDRF1Q3B7T1 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
EDRF1Q3B7T1 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
EDRF1Q3B7T1 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
EDRF1Q3B7T1 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
EDRF1Q3B7T1 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
EDRF1Q3B7T1 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
EDRF1Q3B7T1 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
EDRF1Q3B7T1 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
EDRF1Q3B7T1 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
EDRF1Q3B7T1 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
EDRF1Q3B7T1 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
EDRF1Q3B7T1 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
EDRF1Q3B7T1 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
EDRF1Q3B7T1 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
EDRF1Q3B7T1 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
EDRF1Q3B7T1 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
EDRF1Q3B7T1 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
EDRF1Q3B7T1 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
EDRF1Q3B7T1 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
EDRF1Q3B7T1 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
EDRF1Q3B7T1 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
EDRF1Q3B7T1 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
EDRF1Q3B7T1 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
EDRF1Q3B7T1 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
EDRF1Q3B7T1 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
EDRF1Q3B7T1 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
EDRF1Q3B7T1 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
EDRF1Q3B7T1 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
EDRF1Q3B7T1 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
EDRF1Q3B7T1 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
EDRF1Q3B7T1 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
EDRF1Q3B7T1 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
EDRF1Q3B7T1 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
EDRF1Q3B7T1 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
EDRF1Q3B7T1 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
EDRF1Q3B7T1 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
EDRF1Q3B7T1 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
EDRF1Q3B7T1 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
EDRF1Q3B7T1 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
EDRF1Q3B7T1 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
EDRF1Q3B7T1 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
EDRF1Q3B7T1 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
EDRF1Q3B7T1 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
EDRF1Q3B7T1 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
EDRF1Q3B7T1 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
EDRF1Q3B7T1 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
EDRF1Q3B7T1 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
EDRF1Q3B7T1 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
EDRF1Q3B7T1 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
EDRF1Q3B7T1 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
EDRF1Q3B7T1 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
EDRF1Q3B7T1 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
EDRF1Q3B7T1 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
EDRF1Q3B7T1 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
EDRF1Q3B7T1 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
EDRF1Q3B7T1 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
EDRF1Q3B7T1 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
EDRF1Q3B7T1 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
EDRF1Q3B7T1 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
EDRF1Q3B7T1 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
EDRF1Q3B7T1 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
EDRF1Q3B7T1 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
EDRF1Q3B7T1 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
EDRF1Q3B7T1 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
EDRF1Q3B7T1 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
EDRF1Q3B7T1 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
EDRF1Q3B7T1 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
EDRF1Q3B7T1 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
EDRF1Q3B7T1 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
EDRF1Q3B7T1 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
EDRF1Q3B7T1 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
EDRF1Q3B7T1 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
EDRF1Q3B7T1 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
EDRF1Q3B7T1 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
EDRF1Q3B7T1 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
EDRF1Q3B7T1 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
EDRF1Q3B7T1 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
EDRF1Q3B7T1 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
EDRF1Q3B7T1 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
EDRF1Q3B7T1 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
EDRF1Q3B7T1 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
EDRF1Q3B7T1 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
EDRF1Q3B7T1 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
EDRF1Q3B7T1 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
EDRF1Q3B7T1 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
EDRF1Q3B7T1 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
EDRF1Q3B7T1 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
EDRF1Q3B7T1 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
EDRF1Q3B7T1 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
EDRF1Q3B7T1 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
EDRF1Q3B7T1 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
EDRF1Q3B7T1 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
EDRF1Q3B7T1 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
EDRF1Q3B7T1 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
EDRF1Q3B7T1 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
EDRF1Q3B7T1 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
EDRF1Q3B7T1 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
EDRF1Q3B7T1 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
EDRF1Q3B7T1 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms