Protein–RNA interactions for Protein: Q2V2M9

FHOD3, FH1/FH2 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHOD3Q2V2M9 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
FHOD3Q2V2M9 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
FHOD3Q2V2M9 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
FHOD3Q2V2M9 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
FHOD3Q2V2M9 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.23■■■■□ 3.39
FHOD3Q2V2M9 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC36.23■■■■□ 3.39
FHOD3Q2V2M9 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC36.23■■■■□ 3.39
FHOD3Q2V2M9 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.23■■■■□ 3.39
FHOD3Q2V2M9 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
FHOD3Q2V2M9 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
FHOD3Q2V2M9 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.22■■■■□ 3.39
FHOD3Q2V2M9 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC36.22■■■■□ 3.39
FHOD3Q2V2M9 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
FHOD3Q2V2M9 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
FHOD3Q2V2M9 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
FHOD3Q2V2M9 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.22■■■■□ 3.39
FHOD3Q2V2M9 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
FHOD3Q2V2M9 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC36.21■■■■□ 3.39
FHOD3Q2V2M9 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC36.21■■■■□ 3.39
FHOD3Q2V2M9 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
FHOD3Q2V2M9 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
FHOD3Q2V2M9 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC36.2■■■■□ 3.39
FHOD3Q2V2M9 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
FHOD3Q2V2M9 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
FHOD3Q2V2M9 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC36.2■■■■□ 3.39
FHOD3Q2V2M9 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
FHOD3Q2V2M9 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC36.2■■■■□ 3.39
FHOD3Q2V2M9 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
FHOD3Q2V2M9 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC36.2■■■■□ 3.39
FHOD3Q2V2M9 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC36.2■■■■□ 3.39
FHOD3Q2V2M9 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
FHOD3Q2V2M9 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC36.19■■■■□ 3.38
FHOD3Q2V2M9 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC36.19■■■■□ 3.38
FHOD3Q2V2M9 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC36.19■■■■□ 3.38
FHOD3Q2V2M9 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
FHOD3Q2V2M9 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.19■■■■□ 3.38
FHOD3Q2V2M9 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
FHOD3Q2V2M9 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC36.17■■■■□ 3.38
FHOD3Q2V2M9 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC36.17■■■■□ 3.38
FHOD3Q2V2M9 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.17■■■■□ 3.38
FHOD3Q2V2M9 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC36.16■■■■□ 3.38
FHOD3Q2V2M9 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.16■■■■□ 3.38
FHOD3Q2V2M9 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
FHOD3Q2V2M9 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
FHOD3Q2V2M9 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC36.16■■■■□ 3.38
FHOD3Q2V2M9 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC36.16■■■■□ 3.38
FHOD3Q2V2M9 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC36.16■■■■□ 3.38
FHOD3Q2V2M9 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC36.16■■■■□ 3.38
FHOD3Q2V2M9 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
FHOD3Q2V2M9 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
FHOD3Q2V2M9 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
FHOD3Q2V2M9 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
FHOD3Q2V2M9 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
FHOD3Q2V2M9 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC36.14■■■■□ 3.38
FHOD3Q2V2M9 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC36.14■■■■□ 3.38
FHOD3Q2V2M9 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC36.14■■■■□ 3.38
FHOD3Q2V2M9 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC36.14■■■■□ 3.38
FHOD3Q2V2M9 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC36.14■■■■□ 3.38
FHOD3Q2V2M9 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC36.14■■■■□ 3.38
FHOD3Q2V2M9 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
FHOD3Q2V2M9 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
FHOD3Q2V2M9 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC36.13■■■■□ 3.37
FHOD3Q2V2M9 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC36.13■■■■□ 3.37
FHOD3Q2V2M9 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
FHOD3Q2V2M9 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.13■■■■□ 3.37
FHOD3Q2V2M9 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC36.13■■■■□ 3.37
FHOD3Q2V2M9 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC36.13■■■■□ 3.37
FHOD3Q2V2M9 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC36.13■■■■□ 3.37
FHOD3Q2V2M9 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
FHOD3Q2V2M9 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC36.12■■■■□ 3.37
FHOD3Q2V2M9 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
FHOD3Q2V2M9 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
FHOD3Q2V2M9 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
FHOD3Q2V2M9 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC36.11■■■■□ 3.37
FHOD3Q2V2M9 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC36.11■■■■□ 3.37
FHOD3Q2V2M9 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC36.11■■■■□ 3.37
FHOD3Q2V2M9 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
FHOD3Q2V2M9 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC36.11■■■■□ 3.37
FHOD3Q2V2M9 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
FHOD3Q2V2M9 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC36.11■■■■□ 3.37
FHOD3Q2V2M9 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
FHOD3Q2V2M9 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
FHOD3Q2V2M9 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
FHOD3Q2V2M9 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC36.1■■■■□ 3.37
FHOD3Q2V2M9 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC36.1■■■■□ 3.37
FHOD3Q2V2M9 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
FHOD3Q2V2M9 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
FHOD3Q2V2M9 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
FHOD3Q2V2M9 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.1■■■■□ 3.37
FHOD3Q2V2M9 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.1■■■■□ 3.37
FHOD3Q2V2M9 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC36.09■■■■□ 3.37
FHOD3Q2V2M9 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC36.09■■■■□ 3.37
FHOD3Q2V2M9 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC36.09■■■■□ 3.37
FHOD3Q2V2M9 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
FHOD3Q2V2M9 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.37
FHOD3Q2V2M9 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.07■■■■□ 3.36
FHOD3Q2V2M9 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC36.06■■■■□ 3.36
FHOD3Q2V2M9 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
FHOD3Q2V2M9 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
FHOD3Q2V2M9 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC36.06■■■■□ 3.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 300.1 ms