Protein–RNA interactions for Protein: Q2KN98

Specc1l, Cytospin-A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Specc1lQ2KN98 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Specc1lQ2KN98 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Specc1lQ2KN98 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Specc1lQ2KN98 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Specc1lQ2KN98 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Specc1lQ2KN98 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Specc1lQ2KN98 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Specc1lQ2KN98 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Specc1lQ2KN98 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Specc1lQ2KN98 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Specc1lQ2KN98 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Specc1lQ2KN98 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Specc1lQ2KN98 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Specc1lQ2KN98 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Specc1lQ2KN98 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Specc1lQ2KN98 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Specc1lQ2KN98 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Specc1lQ2KN98 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Specc1lQ2KN98 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Specc1lQ2KN98 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Specc1lQ2KN98 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Specc1lQ2KN98 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Specc1lQ2KN98 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Specc1lQ2KN98 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Specc1lQ2KN98 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Specc1lQ2KN98 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Specc1lQ2KN98 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Specc1lQ2KN98 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Specc1lQ2KN98 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Specc1lQ2KN98 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Specc1lQ2KN98 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Specc1lQ2KN98 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Specc1lQ2KN98 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Specc1lQ2KN98 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Specc1lQ2KN98 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Specc1lQ2KN98 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Specc1lQ2KN98 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Specc1lQ2KN98 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Specc1lQ2KN98 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Specc1lQ2KN98 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Specc1lQ2KN98 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Specc1lQ2KN98 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Specc1lQ2KN98 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Specc1lQ2KN98 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Specc1lQ2KN98 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Specc1lQ2KN98 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Specc1lQ2KN98 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Specc1lQ2KN98 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Specc1lQ2KN98 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Specc1lQ2KN98 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Specc1lQ2KN98 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Specc1lQ2KN98 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Specc1lQ2KN98 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Specc1lQ2KN98 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Specc1lQ2KN98 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Specc1lQ2KN98 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Specc1lQ2KN98 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Specc1lQ2KN98 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Specc1lQ2KN98 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Specc1lQ2KN98 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Specc1lQ2KN98 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Specc1lQ2KN98 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Specc1lQ2KN98 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Specc1lQ2KN98 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Specc1lQ2KN98 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Specc1lQ2KN98 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Specc1lQ2KN98 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Specc1lQ2KN98 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Specc1lQ2KN98 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Specc1lQ2KN98 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Specc1lQ2KN98 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Specc1lQ2KN98 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Specc1lQ2KN98 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Specc1lQ2KN98 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Specc1lQ2KN98 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Specc1lQ2KN98 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Specc1lQ2KN98 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Specc1lQ2KN98 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Specc1lQ2KN98 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Specc1lQ2KN98 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Specc1lQ2KN98 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Specc1lQ2KN98 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Specc1lQ2KN98 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Specc1lQ2KN98 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Specc1lQ2KN98 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Specc1lQ2KN98 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Specc1lQ2KN98 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Specc1lQ2KN98 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Specc1lQ2KN98 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Specc1lQ2KN98 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Specc1lQ2KN98 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Specc1lQ2KN98 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Specc1lQ2KN98 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Specc1lQ2KN98 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Specc1lQ2KN98 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Specc1lQ2KN98 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Specc1lQ2KN98 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Specc1lQ2KN98 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Specc1lQ2KN98 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Specc1lQ2KN98 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms