Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,714 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
COL24A1Q17RW2 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
COL24A1Q17RW2 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
COL24A1Q17RW2 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
COL24A1Q17RW2 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
COL24A1Q17RW2 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
COL24A1Q17RW2 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
COL24A1Q17RW2 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
COL24A1Q17RW2 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
COL24A1Q17RW2 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
COL24A1Q17RW2 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
COL24A1Q17RW2 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
COL24A1Q17RW2 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
COL24A1Q17RW2 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
COL24A1Q17RW2 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
COL24A1Q17RW2 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
COL24A1Q17RW2 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
COL24A1Q17RW2 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
COL24A1Q17RW2 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
COL24A1Q17RW2 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
COL24A1Q17RW2 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC29■■■□□ 2.23
COL24A1Q17RW2 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC29■■■□□ 2.23
COL24A1Q17RW2 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
COL24A1Q17RW2 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
COL24A1Q17RW2 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
COL24A1Q17RW2 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
COL24A1Q17RW2 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
COL24A1Q17RW2 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
COL24A1Q17RW2 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
COL24A1Q17RW2 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
COL24A1Q17RW2 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
COL24A1Q17RW2 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
COL24A1Q17RW2 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
COL24A1Q17RW2 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
COL24A1Q17RW2 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
COL24A1Q17RW2 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
COL24A1Q17RW2 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
COL24A1Q17RW2 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
COL24A1Q17RW2 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
COL24A1Q17RW2 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
COL24A1Q17RW2 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
COL24A1Q17RW2 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
COL24A1Q17RW2 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
COL24A1Q17RW2 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
COL24A1Q17RW2 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
COL24A1Q17RW2 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
COL24A1Q17RW2 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
COL24A1Q17RW2 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
COL24A1Q17RW2 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
COL24A1Q17RW2 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
COL24A1Q17RW2 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
COL24A1Q17RW2 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC28.97■■■□□ 2.23
COL24A1Q17RW2 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
COL24A1Q17RW2 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
COL24A1Q17RW2 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
COL24A1Q17RW2 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
COL24A1Q17RW2 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
COL24A1Q17RW2 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
COL24A1Q17RW2 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
COL24A1Q17RW2 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
COL24A1Q17RW2 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
COL24A1Q17RW2 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
COL24A1Q17RW2 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
COL24A1Q17RW2 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
COL24A1Q17RW2 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
COL24A1Q17RW2 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
COL24A1Q17RW2 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
COL24A1Q17RW2 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
COL24A1Q17RW2 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
COL24A1Q17RW2 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
COL24A1Q17RW2 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
COL24A1Q17RW2 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
COL24A1Q17RW2 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
COL24A1Q17RW2 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
COL24A1Q17RW2 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
COL24A1Q17RW2 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
COL24A1Q17RW2 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
COL24A1Q17RW2 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
COL24A1Q17RW2 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
COL24A1Q17RW2 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
COL24A1Q17RW2 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
COL24A1Q17RW2 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
COL24A1Q17RW2 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
COL24A1Q17RW2 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
COL24A1Q17RW2 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
COL24A1Q17RW2 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
COL24A1Q17RW2 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
COL24A1Q17RW2 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
COL24A1Q17RW2 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
COL24A1Q17RW2 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
COL24A1Q17RW2 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
COL24A1Q17RW2 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
COL24A1Q17RW2 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
COL24A1Q17RW2 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
COL24A1Q17RW2 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
COL24A1Q17RW2 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
COL24A1Q17RW2 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
COL24A1Q17RW2 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
COL24A1Q17RW2 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
COL24A1Q17RW2 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
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