Protein–RNA interactions for Protein: Q13477

MADCAM1, Mucosal addressin cell adhesion molecule 1, humanhuman

Predictions only

Length 382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MADCAM1Q13477 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MADCAM1Q13477 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MADCAM1Q13477 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MADCAM1Q13477 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MADCAM1Q13477 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MADCAM1Q13477 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MADCAM1Q13477 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MADCAM1Q13477 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MADCAM1Q13477 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MADCAM1Q13477 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MADCAM1Q13477 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MADCAM1Q13477 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MADCAM1Q13477 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MADCAM1Q13477 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MADCAM1Q13477 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MADCAM1Q13477 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MADCAM1Q13477 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MADCAM1Q13477 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MADCAM1Q13477 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MADCAM1Q13477 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MADCAM1Q13477 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MADCAM1Q13477 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MADCAM1Q13477 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MADCAM1Q13477 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MADCAM1Q13477 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MADCAM1Q13477 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MADCAM1Q13477 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MADCAM1Q13477 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MADCAM1Q13477 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
MADCAM1Q13477 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MADCAM1Q13477 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MADCAM1Q13477 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MADCAM1Q13477 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MADCAM1Q13477 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MADCAM1Q13477 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
MADCAM1Q13477 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
MADCAM1Q13477 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
MADCAM1Q13477 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
MADCAM1Q13477 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
MADCAM1Q13477 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
MADCAM1Q13477 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MADCAM1Q13477 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
MADCAM1Q13477 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MADCAM1Q13477 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MADCAM1Q13477 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
MADCAM1Q13477 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MADCAM1Q13477 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
MADCAM1Q13477 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MADCAM1Q13477 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MADCAM1Q13477 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MADCAM1Q13477 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MADCAM1Q13477 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
MADCAM1Q13477 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
MADCAM1Q13477 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MADCAM1Q13477 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MADCAM1Q13477 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MADCAM1Q13477 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MADCAM1Q13477 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MADCAM1Q13477 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MADCAM1Q13477 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
MADCAM1Q13477 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
MADCAM1Q13477 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
MADCAM1Q13477 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MADCAM1Q13477 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
MADCAM1Q13477 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MADCAM1Q13477 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MADCAM1Q13477 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MADCAM1Q13477 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MADCAM1Q13477 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MADCAM1Q13477 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MADCAM1Q13477 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MADCAM1Q13477 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MADCAM1Q13477 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MADCAM1Q13477 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MADCAM1Q13477 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MADCAM1Q13477 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MADCAM1Q13477 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MADCAM1Q13477 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
MADCAM1Q13477 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MADCAM1Q13477 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MADCAM1Q13477 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MADCAM1Q13477 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MADCAM1Q13477 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MADCAM1Q13477 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MADCAM1Q13477 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MADCAM1Q13477 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MADCAM1Q13477 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MADCAM1Q13477 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MADCAM1Q13477 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MADCAM1Q13477 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MADCAM1Q13477 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MADCAM1Q13477 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MADCAM1Q13477 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MADCAM1Q13477 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MADCAM1Q13477 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MADCAM1Q13477 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MADCAM1Q13477 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MADCAM1Q13477 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
MADCAM1Q13477 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MADCAM1Q13477 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
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