Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SGCGQ13326 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SGCGQ13326 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SGCGQ13326 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SGCGQ13326 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SGCGQ13326 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SGCGQ13326 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SGCGQ13326 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SGCGQ13326 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SGCGQ13326 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SGCGQ13326 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SGCGQ13326 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SGCGQ13326 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SGCGQ13326 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SGCGQ13326 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SGCGQ13326 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SGCGQ13326 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SGCGQ13326 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SGCGQ13326 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SGCGQ13326 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SGCGQ13326 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SGCGQ13326 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SGCGQ13326 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SGCGQ13326 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SGCGQ13326 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SGCGQ13326 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SGCGQ13326 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SGCGQ13326 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SGCGQ13326 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SGCGQ13326 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SGCGQ13326 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SGCGQ13326 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SGCGQ13326 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SGCGQ13326 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SGCGQ13326 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SGCGQ13326 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SGCGQ13326 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SGCGQ13326 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SGCGQ13326 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SGCGQ13326 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SGCGQ13326 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SGCGQ13326 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SGCGQ13326 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SGCGQ13326 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SGCGQ13326 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SGCGQ13326 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SGCGQ13326 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SGCGQ13326 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SGCGQ13326 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SGCGQ13326 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SGCGQ13326 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SGCGQ13326 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SGCGQ13326 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SGCGQ13326 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SGCGQ13326 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SGCGQ13326 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SGCGQ13326 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SGCGQ13326 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SGCGQ13326 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SGCGQ13326 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SGCGQ13326 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SGCGQ13326 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SGCGQ13326 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SGCGQ13326 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SGCGQ13326 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SGCGQ13326 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SGCGQ13326 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SGCGQ13326 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SGCGQ13326 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SGCGQ13326 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SGCGQ13326 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SGCGQ13326 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SGCGQ13326 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SGCGQ13326 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SGCGQ13326 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SGCGQ13326 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SGCGQ13326 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SGCGQ13326 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SGCGQ13326 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SGCGQ13326 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SGCGQ13326 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SGCGQ13326 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SGCGQ13326 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SGCGQ13326 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SGCGQ13326 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SGCGQ13326 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SGCGQ13326 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SGCGQ13326 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SGCGQ13326 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SGCGQ13326 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SGCGQ13326 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SGCGQ13326 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SGCGQ13326 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SGCGQ13326 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SGCGQ13326 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SGCGQ13326 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SGCGQ13326 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SGCGQ13326 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SGCGQ13326 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SGCGQ13326 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
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