Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SRSF5Q13243 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SRSF5Q13243 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SRSF5Q13243 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SRSF5Q13243 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SRSF5Q13243 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SRSF5Q13243 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SRSF5Q13243 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SRSF5Q13243 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SRSF5Q13243 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SRSF5Q13243 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SRSF5Q13243 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SRSF5Q13243 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SRSF5Q13243 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SRSF5Q13243 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SRSF5Q13243 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SRSF5Q13243 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SRSF5Q13243 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SRSF5Q13243 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SRSF5Q13243 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SRSF5Q13243 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SRSF5Q13243 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SRSF5Q13243 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SRSF5Q13243 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SRSF5Q13243 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SRSF5Q13243 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SRSF5Q13243 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SRSF5Q13243 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SRSF5Q13243 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SRSF5Q13243 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SRSF5Q13243 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SRSF5Q13243 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SRSF5Q13243 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SRSF5Q13243 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SRSF5Q13243 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SRSF5Q13243 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SRSF5Q13243 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SRSF5Q13243 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SRSF5Q13243 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SRSF5Q13243 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SRSF5Q13243 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SRSF5Q13243 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SRSF5Q13243 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SRSF5Q13243 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SRSF5Q13243 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SRSF5Q13243 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SRSF5Q13243 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SRSF5Q13243 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SRSF5Q13243 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SRSF5Q13243 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SRSF5Q13243 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SRSF5Q13243 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SRSF5Q13243 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SRSF5Q13243 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SRSF5Q13243 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SRSF5Q13243 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SRSF5Q13243 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SRSF5Q13243 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SRSF5Q13243 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SRSF5Q13243 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SRSF5Q13243 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SRSF5Q13243 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SRSF5Q13243 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SRSF5Q13243 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SRSF5Q13243 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SRSF5Q13243 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SRSF5Q13243 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SRSF5Q13243 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SRSF5Q13243 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SRSF5Q13243 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SRSF5Q13243 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SRSF5Q13243 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SRSF5Q13243 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SRSF5Q13243 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SRSF5Q13243 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SRSF5Q13243 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SRSF5Q13243 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SRSF5Q13243 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SRSF5Q13243 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SRSF5Q13243 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SRSF5Q13243 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SRSF5Q13243 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SRSF5Q13243 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SRSF5Q13243 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SRSF5Q13243 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SRSF5Q13243 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SRSF5Q13243 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SRSF5Q13243 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SRSF5Q13243 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SRSF5Q13243 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SRSF5Q13243 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SRSF5Q13243 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SRSF5Q13243 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SRSF5Q13243 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SRSF5Q13243 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SRSF5Q13243 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SRSF5Q13243 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SRSF5Q13243 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SRSF5Q13243 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SRSF5Q13243 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
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