Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CALCOCO2Q13137 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CALCOCO2Q13137 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CALCOCO2Q13137 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CALCOCO2Q13137 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CALCOCO2Q13137 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CALCOCO2Q13137 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CALCOCO2Q13137 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CALCOCO2Q13137 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CALCOCO2Q13137 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CALCOCO2Q13137 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CALCOCO2Q13137 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CALCOCO2Q13137 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CALCOCO2Q13137 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CALCOCO2Q13137 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CALCOCO2Q13137 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CALCOCO2Q13137 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CALCOCO2Q13137 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CALCOCO2Q13137 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CALCOCO2Q13137 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CALCOCO2Q13137 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CALCOCO2Q13137 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CALCOCO2Q13137 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CALCOCO2Q13137 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CALCOCO2Q13137 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CALCOCO2Q13137 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CALCOCO2Q13137 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CALCOCO2Q13137 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CALCOCO2Q13137 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CALCOCO2Q13137 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CALCOCO2Q13137 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CALCOCO2Q13137 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CALCOCO2Q13137 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CALCOCO2Q13137 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CALCOCO2Q13137 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CALCOCO2Q13137 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CALCOCO2Q13137 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CALCOCO2Q13137 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CALCOCO2Q13137 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CALCOCO2Q13137 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CALCOCO2Q13137 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CALCOCO2Q13137 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CALCOCO2Q13137 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CALCOCO2Q13137 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CALCOCO2Q13137 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CALCOCO2Q13137 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CALCOCO2Q13137 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CALCOCO2Q13137 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CALCOCO2Q13137 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CALCOCO2Q13137 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CALCOCO2Q13137 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CALCOCO2Q13137 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CALCOCO2Q13137 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CALCOCO2Q13137 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CALCOCO2Q13137 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CALCOCO2Q13137 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CALCOCO2Q13137 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CALCOCO2Q13137 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CALCOCO2Q13137 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CALCOCO2Q13137 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CALCOCO2Q13137 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CALCOCO2Q13137 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CALCOCO2Q13137 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CALCOCO2Q13137 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CALCOCO2Q13137 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CALCOCO2Q13137 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CALCOCO2Q13137 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CALCOCO2Q13137 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CALCOCO2Q13137 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CALCOCO2Q13137 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CALCOCO2Q13137 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CALCOCO2Q13137 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CALCOCO2Q13137 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CALCOCO2Q13137 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CALCOCO2Q13137 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CALCOCO2Q13137 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CALCOCO2Q13137 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CALCOCO2Q13137 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CALCOCO2Q13137 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CALCOCO2Q13137 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CALCOCO2Q13137 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CALCOCO2Q13137 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CALCOCO2Q13137 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CALCOCO2Q13137 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CALCOCO2Q13137 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CALCOCO2Q13137 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CALCOCO2Q13137 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CALCOCO2Q13137 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CALCOCO2Q13137 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CALCOCO2Q13137 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CALCOCO2Q13137 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CALCOCO2Q13137 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CALCOCO2Q13137 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CALCOCO2Q13137 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CALCOCO2Q13137 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CALCOCO2Q13137 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CALCOCO2Q13137 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CALCOCO2Q13137 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CALCOCO2Q13137 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CALCOCO2Q13137 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
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