Protein–RNA interactions for Protein: Q13114

TRAF3, TNF receptor-associated factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3Q13114 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRAF3Q13114 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRAF3Q13114 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRAF3Q13114 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRAF3Q13114 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRAF3Q13114 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRAF3Q13114 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRAF3Q13114 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRAF3Q13114 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRAF3Q13114 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRAF3Q13114 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRAF3Q13114 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRAF3Q13114 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRAF3Q13114 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRAF3Q13114 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRAF3Q13114 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRAF3Q13114 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRAF3Q13114 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRAF3Q13114 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRAF3Q13114 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRAF3Q13114 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRAF3Q13114 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRAF3Q13114 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRAF3Q13114 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRAF3Q13114 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
TRAF3Q13114 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRAF3Q13114 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRAF3Q13114 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRAF3Q13114 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRAF3Q13114 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRAF3Q13114 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRAF3Q13114 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TRAF3Q13114 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRAF3Q13114 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRAF3Q13114 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRAF3Q13114 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRAF3Q13114 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TRAF3Q13114 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TRAF3Q13114 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRAF3Q13114 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TRAF3Q13114 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRAF3Q13114 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRAF3Q13114 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRAF3Q13114 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRAF3Q13114 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRAF3Q13114 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRAF3Q13114 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRAF3Q13114 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRAF3Q13114 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRAF3Q13114 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRAF3Q13114 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRAF3Q13114 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRAF3Q13114 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRAF3Q13114 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRAF3Q13114 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRAF3Q13114 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRAF3Q13114 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TRAF3Q13114 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRAF3Q13114 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRAF3Q13114 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRAF3Q13114 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRAF3Q13114 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRAF3Q13114 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRAF3Q13114 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRAF3Q13114 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRAF3Q13114 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRAF3Q13114 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRAF3Q13114 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRAF3Q13114 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRAF3Q13114 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRAF3Q13114 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TRAF3Q13114 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRAF3Q13114 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRAF3Q13114 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRAF3Q13114 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TRAF3Q13114 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRAF3Q13114 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRAF3Q13114 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRAF3Q13114 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRAF3Q13114 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRAF3Q13114 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRAF3Q13114 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRAF3Q13114 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRAF3Q13114 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRAF3Q13114 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRAF3Q13114 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRAF3Q13114 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRAF3Q13114 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRAF3Q13114 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRAF3Q13114 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRAF3Q13114 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRAF3Q13114 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRAF3Q13114 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRAF3Q13114 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRAF3Q13114 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRAF3Q13114 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRAF3Q13114 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRAF3Q13114 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRAF3Q13114 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRAF3Q13114 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms