Protein–RNA interactions for Protein: Q12893

TMEM115, Transmembrane protein 115, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM115Q12893 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM115Q12893 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TMEM115Q12893 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TMEM115Q12893 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TMEM115Q12893 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM115Q12893 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM115Q12893 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM115Q12893 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM115Q12893 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM115Q12893 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM115Q12893 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM115Q12893 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM115Q12893 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM115Q12893 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM115Q12893 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM115Q12893 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM115Q12893 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM115Q12893 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM115Q12893 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM115Q12893 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM115Q12893 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM115Q12893 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM115Q12893 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM115Q12893 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM115Q12893 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM115Q12893 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM115Q12893 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM115Q12893 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM115Q12893 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM115Q12893 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM115Q12893 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM115Q12893 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM115Q12893 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM115Q12893 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM115Q12893 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM115Q12893 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM115Q12893 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM115Q12893 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM115Q12893 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM115Q12893 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM115Q12893 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM115Q12893 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM115Q12893 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM115Q12893 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM115Q12893 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM115Q12893 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM115Q12893 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM115Q12893 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM115Q12893 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM115Q12893 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM115Q12893 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM115Q12893 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM115Q12893 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM115Q12893 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM115Q12893 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM115Q12893 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM115Q12893 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM115Q12893 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM115Q12893 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM115Q12893 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM115Q12893 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM115Q12893 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM115Q12893 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM115Q12893 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM115Q12893 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM115Q12893 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM115Q12893 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM115Q12893 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM115Q12893 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM115Q12893 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM115Q12893 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM115Q12893 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM115Q12893 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMEM115Q12893 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMEM115Q12893 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMEM115Q12893 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TMEM115Q12893 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TMEM115Q12893 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TMEM115Q12893 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM115Q12893 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM115Q12893 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM115Q12893 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM115Q12893 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM115Q12893 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM115Q12893 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM115Q12893 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM115Q12893 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM115Q12893 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM115Q12893 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM115Q12893 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM115Q12893 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM115Q12893 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM115Q12893 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM115Q12893 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM115Q12893 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM115Q12893 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM115Q12893 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM115Q12893 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM115Q12893 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM115Q12893 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms