Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NFIAQ12857 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NFIAQ12857 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NFIAQ12857 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NFIAQ12857 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NFIAQ12857 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NFIAQ12857 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NFIAQ12857 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
NFIAQ12857 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC27.08■■□□□ 1.92
NFIAQ12857 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.92
NFIAQ12857 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NFIAQ12857 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NFIAQ12857 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NFIAQ12857 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NFIAQ12857 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NFIAQ12857 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NFIAQ12857 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NFIAQ12857 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NFIAQ12857 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NFIAQ12857 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NFIAQ12857 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NFIAQ12857 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NFIAQ12857 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NFIAQ12857 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NFIAQ12857 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NFIAQ12857 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NFIAQ12857 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NFIAQ12857 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NFIAQ12857 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NFIAQ12857 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NFIAQ12857 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
NFIAQ12857 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NFIAQ12857 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NFIAQ12857 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NFIAQ12857 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NFIAQ12857 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NFIAQ12857 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NFIAQ12857 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NFIAQ12857 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NFIAQ12857 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NFIAQ12857 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NFIAQ12857 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NFIAQ12857 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NFIAQ12857 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
NFIAQ12857 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NFIAQ12857 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NFIAQ12857 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NFIAQ12857 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NFIAQ12857 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NFIAQ12857 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NFIAQ12857 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NFIAQ12857 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
NFIAQ12857 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NFIAQ12857 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
NFIAQ12857 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
NFIAQ12857 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NFIAQ12857 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NFIAQ12857 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NFIAQ12857 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NFIAQ12857 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NFIAQ12857 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NFIAQ12857 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
NFIAQ12857 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NFIAQ12857 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NFIAQ12857 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NFIAQ12857 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
NFIAQ12857 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NFIAQ12857 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NFIAQ12857 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NFIAQ12857 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NFIAQ12857 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
NFIAQ12857 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
NFIAQ12857 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
NFIAQ12857 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC27■■□□□ 1.91
NFIAQ12857 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NFIAQ12857 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NFIAQ12857 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
NFIAQ12857 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NFIAQ12857 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NFIAQ12857 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NFIAQ12857 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
NFIAQ12857 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
NFIAQ12857 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
NFIAQ12857 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
NFIAQ12857 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NFIAQ12857 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NFIAQ12857 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NFIAQ12857 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NFIAQ12857 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NFIAQ12857 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NFIAQ12857 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
NFIAQ12857 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NFIAQ12857 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NFIAQ12857 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NFIAQ12857 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NFIAQ12857 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NFIAQ12857 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NFIAQ12857 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
NFIAQ12857 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NFIAQ12857 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
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