Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGB7

Ppp4r2, Serine/threonine-protein phosphatase 4 regulatory subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp4r2Q0VGB7 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ppp4r2Q0VGB7 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ppp4r2Q0VGB7 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ppp4r2Q0VGB7 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ppp4r2Q0VGB7 Gm37102-201ENSMUST00000195740 1105 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Ppp4r2Q0VGB7 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ppp4r2Q0VGB7 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ppp4r2Q0VGB7 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ppp4r2Q0VGB7 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ppp4r2Q0VGB7 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ppp4r2Q0VGB7 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ppp4r2Q0VGB7 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Ppp4r2Q0VGB7 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ppp4r2Q0VGB7 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ppp4r2Q0VGB7 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ppp4r2Q0VGB7 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ppp4r2Q0VGB7 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ppp4r2Q0VGB7 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ppp4r2Q0VGB7 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ppp4r2Q0VGB7 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ppp4r2Q0VGB7 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Ppp4r2Q0VGB7 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ppp4r2Q0VGB7 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ppp4r2Q0VGB7 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ppp4r2Q0VGB7 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ppp4r2Q0VGB7 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ppp4r2Q0VGB7 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ppp4r2Q0VGB7 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ppp4r2Q0VGB7 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ppp4r2Q0VGB7 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ppp4r2Q0VGB7 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ppp4r2Q0VGB7 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Ppp4r2Q0VGB7 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ppp4r2Q0VGB7 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ppp4r2Q0VGB7 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ppp4r2Q0VGB7 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ppp4r2Q0VGB7 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ppp4r2Q0VGB7 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ppp4r2Q0VGB7 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ppp4r2Q0VGB7 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ppp4r2Q0VGB7 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ppp4r2Q0VGB7 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ppp4r2Q0VGB7 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ppp4r2Q0VGB7 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ppp4r2Q0VGB7 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ppp4r2Q0VGB7 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ppp4r2Q0VGB7 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ppp4r2Q0VGB7 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ppp4r2Q0VGB7 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ppp4r2Q0VGB7 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ppp4r2Q0VGB7 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ppp4r2Q0VGB7 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ppp4r2Q0VGB7 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ppp4r2Q0VGB7 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ppp4r2Q0VGB7 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ppp4r2Q0VGB7 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ppp4r2Q0VGB7 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Ppp4r2Q0VGB7 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ppp4r2Q0VGB7 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ppp4r2Q0VGB7 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ppp4r2Q0VGB7 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ppp4r2Q0VGB7 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ppp4r2Q0VGB7 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ppp4r2Q0VGB7 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ppp4r2Q0VGB7 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ppp4r2Q0VGB7 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ppp4r2Q0VGB7 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ppp4r2Q0VGB7 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Ppp4r2Q0VGB7 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ppp4r2Q0VGB7 Gm37083-201ENSMUST00000195784 711 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
Ppp4r2Q0VGB7 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
Ppp4r2Q0VGB7 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ppp4r2Q0VGB7 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ppp4r2Q0VGB7 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ppp4r2Q0VGB7 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ppp4r2Q0VGB7 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ppp4r2Q0VGB7 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ppp4r2Q0VGB7 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Ppp4r2Q0VGB7 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ppp4r2Q0VGB7 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ppp4r2Q0VGB7 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ppp4r2Q0VGB7 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ppp4r2Q0VGB7 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ppp4r2Q0VGB7 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ppp4r2Q0VGB7 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ppp4r2Q0VGB7 Gm13546-201ENSMUST00000135735 401 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ppp4r2Q0VGB7 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ppp4r2Q0VGB7 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ppp4r2Q0VGB7 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ppp4r2Q0VGB7 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ppp4r2Q0VGB7 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ppp4r2Q0VGB7 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ppp4r2Q0VGB7 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Ppp4r2Q0VGB7 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ppp4r2Q0VGB7 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ppp4r2Q0VGB7 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ppp4r2Q0VGB7 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ppp4r2Q0VGB7 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ppp4r2Q0VGB7 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ppp4r2Q0VGB7 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.9 ms