Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAX3

Fads2p1, Fatty acid desaturase 2-like protein FADS2P1, mousemouse

Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fads2p1Q0VAX3 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fads2p1Q0VAX3 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fads2p1Q0VAX3 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fads2p1Q0VAX3 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fads2p1Q0VAX3 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fads2p1Q0VAX3 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Fads2p1Q0VAX3 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fads2p1Q0VAX3 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fads2p1Q0VAX3 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fads2p1Q0VAX3 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fads2p1Q0VAX3 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fads2p1Q0VAX3 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fads2p1Q0VAX3 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Fads2p1Q0VAX3 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fads2p1Q0VAX3 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Fads2p1Q0VAX3 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fads2p1Q0VAX3 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Fads2p1Q0VAX3 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fads2p1Q0VAX3 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fads2p1Q0VAX3 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Fads2p1Q0VAX3 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fads2p1Q0VAX3 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fads2p1Q0VAX3 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fads2p1Q0VAX3 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Fads2p1Q0VAX3 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fads2p1Q0VAX3 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Fads2p1Q0VAX3 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fads2p1Q0VAX3 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fads2p1Q0VAX3 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fads2p1Q0VAX3 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Fads2p1Q0VAX3 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Fads2p1Q0VAX3 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fads2p1Q0VAX3 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fads2p1Q0VAX3 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fads2p1Q0VAX3 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Fads2p1Q0VAX3 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Fads2p1Q0VAX3 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Fads2p1Q0VAX3 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Fads2p1Q0VAX3 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fads2p1Q0VAX3 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fads2p1Q0VAX3 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fads2p1Q0VAX3 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fads2p1Q0VAX3 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fads2p1Q0VAX3 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fads2p1Q0VAX3 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fads2p1Q0VAX3 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fads2p1Q0VAX3 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fads2p1Q0VAX3 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fads2p1Q0VAX3 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fads2p1Q0VAX3 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fads2p1Q0VAX3 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fads2p1Q0VAX3 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fads2p1Q0VAX3 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Fads2p1Q0VAX3 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fads2p1Q0VAX3 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fads2p1Q0VAX3 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fads2p1Q0VAX3 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fads2p1Q0VAX3 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fads2p1Q0VAX3 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fads2p1Q0VAX3 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fads2p1Q0VAX3 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fads2p1Q0VAX3 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fads2p1Q0VAX3 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fads2p1Q0VAX3 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fads2p1Q0VAX3 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fads2p1Q0VAX3 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fads2p1Q0VAX3 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fads2p1Q0VAX3 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fads2p1Q0VAX3 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fads2p1Q0VAX3 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fads2p1Q0VAX3 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fads2p1Q0VAX3 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Fads2p1Q0VAX3 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fads2p1Q0VAX3 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fads2p1Q0VAX3 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fads2p1Q0VAX3 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fads2p1Q0VAX3 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fads2p1Q0VAX3 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Fads2p1Q0VAX3 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Fads2p1Q0VAX3 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Fads2p1Q0VAX3 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Fads2p1Q0VAX3 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Fads2p1Q0VAX3 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Fads2p1Q0VAX3 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Fads2p1Q0VAX3 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fads2p1Q0VAX3 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fads2p1Q0VAX3 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fads2p1Q0VAX3 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fads2p1Q0VAX3 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fads2p1Q0VAX3 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fads2p1Q0VAX3 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fads2p1Q0VAX3 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fads2p1Q0VAX3 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fads2p1Q0VAX3 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Fads2p1Q0VAX3 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fads2p1Q0VAX3 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fads2p1Q0VAX3 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fads2p1Q0VAX3 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fads2p1Q0VAX3 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fads2p1Q0VAX3 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms