Protein–RNA interactions for Protein: Q08874

Mitf, Microphthalmia-associated transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MitfQ08874 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
MitfQ08874 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
MitfQ08874 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
MitfQ08874 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
MitfQ08874 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
MitfQ08874 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
MitfQ08874 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
MitfQ08874 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
MitfQ08874 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
MitfQ08874 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
MitfQ08874 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
MitfQ08874 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
MitfQ08874 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
MitfQ08874 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
MitfQ08874 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
MitfQ08874 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
MitfQ08874 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
MitfQ08874 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
MitfQ08874 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
MitfQ08874 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MitfQ08874 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MitfQ08874 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MitfQ08874 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MitfQ08874 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
MitfQ08874 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MitfQ08874 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MitfQ08874 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MitfQ08874 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
MitfQ08874 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MitfQ08874 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MitfQ08874 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
MitfQ08874 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
MitfQ08874 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MitfQ08874 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MitfQ08874 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MitfQ08874 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MitfQ08874 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MitfQ08874 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MitfQ08874 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
MitfQ08874 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MitfQ08874 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MitfQ08874 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MitfQ08874 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MitfQ08874 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
MitfQ08874 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MitfQ08874 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MitfQ08874 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MitfQ08874 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MitfQ08874 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MitfQ08874 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MitfQ08874 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MitfQ08874 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MitfQ08874 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MitfQ08874 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MitfQ08874 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MitfQ08874 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MitfQ08874 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MitfQ08874 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MitfQ08874 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MitfQ08874 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MitfQ08874 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
MitfQ08874 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
MitfQ08874 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MitfQ08874 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MitfQ08874 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MitfQ08874 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MitfQ08874 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
MitfQ08874 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
MitfQ08874 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
MitfQ08874 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MitfQ08874 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MitfQ08874 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MitfQ08874 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
MitfQ08874 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
MitfQ08874 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MitfQ08874 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MitfQ08874 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
MitfQ08874 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
MitfQ08874 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
MitfQ08874 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
MitfQ08874 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
MitfQ08874 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
MitfQ08874 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
MitfQ08874 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
MitfQ08874 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
MitfQ08874 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
MitfQ08874 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
MitfQ08874 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
MitfQ08874 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
MitfQ08874 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
MitfQ08874 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
MitfQ08874 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
MitfQ08874 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
MitfQ08874 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
MitfQ08874 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
MitfQ08874 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
MitfQ08874 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
MitfQ08874 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
MitfQ08874 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
MitfQ08874 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.8 ms