Protein–RNA interactions for Protein: Q06348

Prrx2, Paired mesoderm homeobox protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrx2Q06348 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Prrx2Q06348 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Prrx2Q06348 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Prrx2Q06348 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Prrx2Q06348 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Prrx2Q06348 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Prrx2Q06348 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Prrx2Q06348 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Prrx2Q06348 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Prrx2Q06348 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Prrx2Q06348 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Prrx2Q06348 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Prrx2Q06348 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Prrx2Q06348 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Prrx2Q06348 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Prrx2Q06348 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Prrx2Q06348 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Prrx2Q06348 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Prrx2Q06348 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Prrx2Q06348 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Prrx2Q06348 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Prrx2Q06348 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Prrx2Q06348 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Prrx2Q06348 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Prrx2Q06348 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Prrx2Q06348 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Prrx2Q06348 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Prrx2Q06348 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Prrx2Q06348 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Prrx2Q06348 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Prrx2Q06348 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Prrx2Q06348 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Prrx2Q06348 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Prrx2Q06348 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Prrx2Q06348 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Prrx2Q06348 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Prrx2Q06348 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Prrx2Q06348 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Prrx2Q06348 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Prrx2Q06348 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Prrx2Q06348 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Prrx2Q06348 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Prrx2Q06348 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Prrx2Q06348 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Prrx2Q06348 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Prrx2Q06348 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Prrx2Q06348 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Prrx2Q06348 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Prrx2Q06348 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prrx2Q06348 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prrx2Q06348 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prrx2Q06348 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Prrx2Q06348 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prrx2Q06348 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prrx2Q06348 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prrx2Q06348 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prrx2Q06348 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Prrx2Q06348 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prrx2Q06348 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prrx2Q06348 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prrx2Q06348 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prrx2Q06348 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prrx2Q06348 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prrx2Q06348 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prrx2Q06348 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prrx2Q06348 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prrx2Q06348 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prrx2Q06348 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prrx2Q06348 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prrx2Q06348 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prrx2Q06348 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prrx2Q06348 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prrx2Q06348 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prrx2Q06348 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prrx2Q06348 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prrx2Q06348 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prrx2Q06348 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prrx2Q06348 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prrx2Q06348 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prrx2Q06348 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prrx2Q06348 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prrx2Q06348 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prrx2Q06348 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prrx2Q06348 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Prrx2Q06348 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prrx2Q06348 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prrx2Q06348 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prrx2Q06348 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Prrx2Q06348 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Prrx2Q06348 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Prrx2Q06348 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Prrx2Q06348 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Prrx2Q06348 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Prrx2Q06348 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Prrx2Q06348 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Prrx2Q06348 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Prrx2Q06348 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Prrx2Q06348 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Prrx2Q06348 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Prrx2Q06348 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms