Protein–RNA interactions for Protein: Q03137

Epha4, Ephrin type-A receptor 4, mousemouse

Predictions only

Length 986 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epha4Q03137 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Epha4Q03137 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Epha4Q03137 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Epha4Q03137 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Epha4Q03137 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Epha4Q03137 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Epha4Q03137 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Epha4Q03137 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Epha4Q03137 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Epha4Q03137 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Epha4Q03137 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Epha4Q03137 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Epha4Q03137 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Epha4Q03137 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Epha4Q03137 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Epha4Q03137 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Epha4Q03137 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Epha4Q03137 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Epha4Q03137 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Epha4Q03137 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Epha4Q03137 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Epha4Q03137 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Epha4Q03137 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Epha4Q03137 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Epha4Q03137 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Epha4Q03137 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Epha4Q03137 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Epha4Q03137 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Epha4Q03137 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Epha4Q03137 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Epha4Q03137 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Epha4Q03137 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Epha4Q03137 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Epha4Q03137 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Epha4Q03137 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Epha4Q03137 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Epha4Q03137 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Epha4Q03137 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Epha4Q03137 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Epha4Q03137 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Epha4Q03137 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Epha4Q03137 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Epha4Q03137 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Epha4Q03137 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Epha4Q03137 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Epha4Q03137 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Epha4Q03137 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Epha4Q03137 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Epha4Q03137 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Epha4Q03137 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Epha4Q03137 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Epha4Q03137 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Epha4Q03137 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Epha4Q03137 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Epha4Q03137 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Epha4Q03137 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Epha4Q03137 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Epha4Q03137 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Epha4Q03137 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Epha4Q03137 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Epha4Q03137 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Epha4Q03137 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Epha4Q03137 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Epha4Q03137 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Epha4Q03137 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Epha4Q03137 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Epha4Q03137 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Epha4Q03137 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Epha4Q03137 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Epha4Q03137 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Epha4Q03137 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Epha4Q03137 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Epha4Q03137 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Epha4Q03137 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Epha4Q03137 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Epha4Q03137 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Epha4Q03137 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Epha4Q03137 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Epha4Q03137 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Epha4Q03137 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Epha4Q03137 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Epha4Q03137 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Epha4Q03137 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Epha4Q03137 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Epha4Q03137 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Epha4Q03137 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Epha4Q03137 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Epha4Q03137 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Epha4Q03137 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Epha4Q03137 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Epha4Q03137 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Epha4Q03137 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Epha4Q03137 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Epha4Q03137 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Epha4Q03137 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Epha4Q03137 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Epha4Q03137 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Epha4Q03137 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Epha4Q03137 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Epha4Q03137 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms