Protein–RNA interactions for Protein: Q02956

Prkcz, Protein kinase C zeta type, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkczQ02956 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PrkczQ02956 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PrkczQ02956 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PrkczQ02956 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PrkczQ02956 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PrkczQ02956 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PrkczQ02956 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PrkczQ02956 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PrkczQ02956 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PrkczQ02956 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PrkczQ02956 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PrkczQ02956 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PrkczQ02956 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PrkczQ02956 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PrkczQ02956 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PrkczQ02956 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PrkczQ02956 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PrkczQ02956 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PrkczQ02956 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PrkczQ02956 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PrkczQ02956 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PrkczQ02956 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PrkczQ02956 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PrkczQ02956 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PrkczQ02956 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PrkczQ02956 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PrkczQ02956 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PrkczQ02956 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PrkczQ02956 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PrkczQ02956 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PrkczQ02956 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PrkczQ02956 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PrkczQ02956 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PrkczQ02956 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PrkczQ02956 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PrkczQ02956 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PrkczQ02956 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PrkczQ02956 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PrkczQ02956 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PrkczQ02956 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PrkczQ02956 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PrkczQ02956 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PrkczQ02956 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PrkczQ02956 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PrkczQ02956 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PrkczQ02956 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PrkczQ02956 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PrkczQ02956 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PrkczQ02956 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PrkczQ02956 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PrkczQ02956 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PrkczQ02956 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PrkczQ02956 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PrkczQ02956 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PrkczQ02956 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PrkczQ02956 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PrkczQ02956 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PrkczQ02956 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PrkczQ02956 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PrkczQ02956 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PrkczQ02956 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PrkczQ02956 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PrkczQ02956 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PrkczQ02956 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PrkczQ02956 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PrkczQ02956 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PrkczQ02956 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PrkczQ02956 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PrkczQ02956 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PrkczQ02956 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PrkczQ02956 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PrkczQ02956 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PrkczQ02956 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PrkczQ02956 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PrkczQ02956 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PrkczQ02956 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PrkczQ02956 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PrkczQ02956 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PrkczQ02956 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PrkczQ02956 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PrkczQ02956 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PrkczQ02956 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PrkczQ02956 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PrkczQ02956 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PrkczQ02956 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PrkczQ02956 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PrkczQ02956 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PrkczQ02956 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PrkczQ02956 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PrkczQ02956 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PrkczQ02956 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PrkczQ02956 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PrkczQ02956 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PrkczQ02956 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PrkczQ02956 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PrkczQ02956 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PrkczQ02956 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PrkczQ02956 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PrkczQ02956 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PrkczQ02956 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms