Protein–RNA interactions for Protein: Q02156

PRKCE, Protein kinase C epsilon type, humanhuman

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCEQ02156 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRKCEQ02156 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRKCEQ02156 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRKCEQ02156 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRKCEQ02156 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRKCEQ02156 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRKCEQ02156 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRKCEQ02156 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRKCEQ02156 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRKCEQ02156 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRKCEQ02156 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRKCEQ02156 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRKCEQ02156 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRKCEQ02156 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRKCEQ02156 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRKCEQ02156 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRKCEQ02156 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRKCEQ02156 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRKCEQ02156 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRKCEQ02156 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRKCEQ02156 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRKCEQ02156 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRKCEQ02156 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRKCEQ02156 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRKCEQ02156 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRKCEQ02156 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRKCEQ02156 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRKCEQ02156 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRKCEQ02156 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRKCEQ02156 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRKCEQ02156 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRKCEQ02156 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRKCEQ02156 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
PRKCEQ02156 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRKCEQ02156 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRKCEQ02156 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PRKCEQ02156 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRKCEQ02156 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRKCEQ02156 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRKCEQ02156 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRKCEQ02156 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRKCEQ02156 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRKCEQ02156 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRKCEQ02156 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRKCEQ02156 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRKCEQ02156 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRKCEQ02156 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRKCEQ02156 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRKCEQ02156 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRKCEQ02156 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRKCEQ02156 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRKCEQ02156 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRKCEQ02156 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
PRKCEQ02156 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRKCEQ02156 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
PRKCEQ02156 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRKCEQ02156 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRKCEQ02156 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRKCEQ02156 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRKCEQ02156 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRKCEQ02156 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRKCEQ02156 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRKCEQ02156 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRKCEQ02156 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRKCEQ02156 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRKCEQ02156 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRKCEQ02156 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRKCEQ02156 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRKCEQ02156 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRKCEQ02156 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRKCEQ02156 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRKCEQ02156 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
PRKCEQ02156 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRKCEQ02156 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRKCEQ02156 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRKCEQ02156 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRKCEQ02156 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRKCEQ02156 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRKCEQ02156 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
PRKCEQ02156 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
PRKCEQ02156 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRKCEQ02156 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRKCEQ02156 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRKCEQ02156 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.63
PRKCEQ02156 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PRKCEQ02156 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PRKCEQ02156 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRKCEQ02156 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRKCEQ02156 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRKCEQ02156 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRKCEQ02156 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
PRKCEQ02156 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRKCEQ02156 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRKCEQ02156 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
PRKCEQ02156 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRKCEQ02156 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRKCEQ02156 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRKCEQ02156 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
PRKCEQ02156 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
PRKCEQ02156 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms