Protein–RNA interactions for Protein: Q00610

CLTC, Clathrin heavy chain 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTCQ00610 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC33.62■■■□□ 2.97
CLTCQ00610 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC33.62■■■□□ 2.97
CLTCQ00610 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC33.62■■■□□ 2.97
CLTCQ00610 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC33.62■■■□□ 2.97
CLTCQ00610 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC33.62■■■□□ 2.97
CLTCQ00610 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
CLTCQ00610 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC33.62■■■□□ 2.97
CLTCQ00610 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
CLTCQ00610 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
CLTCQ00610 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
CLTCQ00610 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
CLTCQ00610 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
CLTCQ00610 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
CLTCQ00610 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
CLTCQ00610 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC33.61■■■□□ 2.97
CLTCQ00610 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
CLTCQ00610 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
CLTCQ00610 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
CLTCQ00610 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
CLTCQ00610 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
CLTCQ00610 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
CLTCQ00610 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
CLTCQ00610 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC33.59■■■□□ 2.97
CLTCQ00610 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
CLTCQ00610 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
CLTCQ00610 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
CLTCQ00610 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC33.59■■■□□ 2.97
CLTCQ00610 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
CLTCQ00610 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC33.58■■■□□ 2.97
CLTCQ00610 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
CLTCQ00610 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC33.58■■■□□ 2.97
CLTCQ00610 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
CLTCQ00610 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
CLTCQ00610 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
CLTCQ00610 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
CLTCQ00610 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC33.58■■■□□ 2.97
CLTCQ00610 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.96
CLTCQ00610 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
CLTCQ00610 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.96
CLTCQ00610 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
CLTCQ00610 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.96
CLTCQ00610 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
CLTCQ00610 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
CLTCQ00610 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
CLTCQ00610 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC33.56■■■□□ 2.96
CLTCQ00610 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
CLTCQ00610 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
CLTCQ00610 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC33.55■■■□□ 2.96
CLTCQ00610 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC33.55■■■□□ 2.96
CLTCQ00610 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
CLTCQ00610 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
CLTCQ00610 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC33.55■■■□□ 2.96
CLTCQ00610 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
CLTCQ00610 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC33.55■■■□□ 2.96
CLTCQ00610 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
CLTCQ00610 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
CLTCQ00610 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC33.54■■■□□ 2.96
CLTCQ00610 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
CLTCQ00610 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
CLTCQ00610 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
CLTCQ00610 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
CLTCQ00610 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
CLTCQ00610 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
CLTCQ00610 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
CLTCQ00610 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
CLTCQ00610 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC33.52■■■□□ 2.96
CLTCQ00610 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC33.52■■■□□ 2.96
CLTCQ00610 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
CLTCQ00610 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
CLTCQ00610 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
CLTCQ00610 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
CLTCQ00610 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
CLTCQ00610 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
CLTCQ00610 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
CLTCQ00610 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC33.5■■■□□ 2.95
CLTCQ00610 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
CLTCQ00610 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
CLTCQ00610 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
CLTCQ00610 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
CLTCQ00610 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
CLTCQ00610 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
CLTCQ00610 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
CLTCQ00610 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
CLTCQ00610 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC33.48■■■□□ 2.95
CLTCQ00610 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
CLTCQ00610 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
CLTCQ00610 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
CLTCQ00610 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
CLTCQ00610 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
CLTCQ00610 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
CLTCQ00610 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
CLTCQ00610 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
CLTCQ00610 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
CLTCQ00610 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
CLTCQ00610 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
CLTCQ00610 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
CLTCQ00610 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
CLTCQ00610 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
CLTCQ00610 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
CLTCQ00610 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 120 ms