Protein–RNA interactions for Protein: Q00535

CDK5, Cyclin-dependent-like kinase 5, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5Q00535 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CDK5Q00535 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CDK5Q00535 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CDK5Q00535 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CDK5Q00535 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CDK5Q00535 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CDK5Q00535 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CDK5Q00535 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CDK5Q00535 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
CDK5Q00535 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CDK5Q00535 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDK5Q00535 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDK5Q00535 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDK5Q00535 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CDK5Q00535 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDK5Q00535 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDK5Q00535 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CDK5Q00535 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDK5Q00535 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CDK5Q00535 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CDK5Q00535 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CDK5Q00535 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CDK5Q00535 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CDK5Q00535 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CDK5Q00535 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CDK5Q00535 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CDK5Q00535 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CDK5Q00535 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CDK5Q00535 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CDK5Q00535 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CDK5Q00535 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDK5Q00535 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDK5Q00535 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDK5Q00535 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDK5Q00535 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDK5Q00535 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDK5Q00535 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDK5Q00535 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDK5Q00535 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDK5Q00535 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDK5Q00535 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDK5Q00535 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDK5Q00535 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDK5Q00535 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDK5Q00535 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDK5Q00535 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDK5Q00535 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDK5Q00535 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDK5Q00535 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDK5Q00535 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CDK5Q00535 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDK5Q00535 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CDK5Q00535 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDK5Q00535 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDK5Q00535 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDK5Q00535 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDK5Q00535 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDK5Q00535 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDK5Q00535 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDK5Q00535 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDK5Q00535 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDK5Q00535 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDK5Q00535 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDK5Q00535 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDK5Q00535 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDK5Q00535 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDK5Q00535 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDK5Q00535 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDK5Q00535 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDK5Q00535 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDK5Q00535 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDK5Q00535 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDK5Q00535 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDK5Q00535 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CDK5Q00535 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDK5Q00535 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDK5Q00535 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDK5Q00535 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDK5Q00535 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDK5Q00535 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDK5Q00535 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDK5Q00535 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDK5Q00535 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDK5Q00535 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDK5Q00535 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDK5Q00535 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDK5Q00535 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDK5Q00535 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDK5Q00535 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDK5Q00535 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDK5Q00535 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDK5Q00535 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDK5Q00535 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDK5Q00535 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDK5Q00535 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDK5Q00535 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDK5Q00535 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDK5Q00535 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDK5Q00535 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDK5Q00535 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms