Protein–RNA interactions for Protein: Q00420

Gabpb1, GA-binding protein subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabpb1Q00420 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gabpb1Q00420 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gabpb1Q00420 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gabpb1Q00420 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gabpb1Q00420 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gabpb1Q00420 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gabpb1Q00420 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gabpb1Q00420 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Gabpb1Q00420 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gabpb1Q00420 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gabpb1Q00420 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gabpb1Q00420 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gabpb1Q00420 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gabpb1Q00420 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Gabpb1Q00420 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gabpb1Q00420 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gabpb1Q00420 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gabpb1Q00420 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gabpb1Q00420 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gabpb1Q00420 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gabpb1Q00420 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gabpb1Q00420 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gabpb1Q00420 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gabpb1Q00420 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gabpb1Q00420 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gabpb1Q00420 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gabpb1Q00420 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gabpb1Q00420 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gabpb1Q00420 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gabpb1Q00420 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gabpb1Q00420 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Gabpb1Q00420 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Gabpb1Q00420 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gabpb1Q00420 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gabpb1Q00420 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gabpb1Q00420 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gabpb1Q00420 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gabpb1Q00420 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gabpb1Q00420 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gabpb1Q00420 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gabpb1Q00420 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gabpb1Q00420 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gabpb1Q00420 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gabpb1Q00420 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gabpb1Q00420 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gabpb1Q00420 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gabpb1Q00420 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gabpb1Q00420 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Gabpb1Q00420 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gabpb1Q00420 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gabpb1Q00420 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gabpb1Q00420 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Gabpb1Q00420 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gabpb1Q00420 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gabpb1Q00420 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Gabpb1Q00420 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gabpb1Q00420 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gabpb1Q00420 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gabpb1Q00420 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gabpb1Q00420 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gabpb1Q00420 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gabpb1Q00420 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gabpb1Q00420 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gabpb1Q00420 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gabpb1Q00420 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gabpb1Q00420 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gabpb1Q00420 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gabpb1Q00420 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gabpb1Q00420 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gabpb1Q00420 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gabpb1Q00420 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gabpb1Q00420 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gabpb1Q00420 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gabpb1Q00420 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gabpb1Q00420 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gabpb1Q00420 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gabpb1Q00420 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gabpb1Q00420 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gabpb1Q00420 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gabpb1Q00420 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gabpb1Q00420 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gabpb1Q00420 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gabpb1Q00420 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gabpb1Q00420 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gabpb1Q00420 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gabpb1Q00420 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gabpb1Q00420 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gabpb1Q00420 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gabpb1Q00420 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gabpb1Q00420 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gabpb1Q00420 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gabpb1Q00420 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gabpb1Q00420 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Gabpb1Q00420 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Gabpb1Q00420 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Gabpb1Q00420 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Gabpb1Q00420 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gabpb1Q00420 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gabpb1Q00420 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gabpb1Q00420 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 144.9 ms