Protein–RNA interactions for Protein: P98173

FAM3A, Protein FAM3A, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3AP98173 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
FAM3AP98173 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
FAM3AP98173 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
FAM3AP98173 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
FAM3AP98173 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
FAM3AP98173 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
FAM3AP98173 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
FAM3AP98173 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
FAM3AP98173 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
FAM3AP98173 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
FAM3AP98173 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
FAM3AP98173 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
FAM3AP98173 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
FAM3AP98173 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
FAM3AP98173 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
FAM3AP98173 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
FAM3AP98173 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
FAM3AP98173 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
FAM3AP98173 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
FAM3AP98173 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
FAM3AP98173 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
FAM3AP98173 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
FAM3AP98173 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
FAM3AP98173 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
FAM3AP98173 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
FAM3AP98173 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
FAM3AP98173 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
FAM3AP98173 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
FAM3AP98173 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
FAM3AP98173 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
FAM3AP98173 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
FAM3AP98173 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
FAM3AP98173 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
FAM3AP98173 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
FAM3AP98173 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
FAM3AP98173 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
FAM3AP98173 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
FAM3AP98173 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
FAM3AP98173 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
FAM3AP98173 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
FAM3AP98173 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
FAM3AP98173 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
FAM3AP98173 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
FAM3AP98173 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
FAM3AP98173 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
FAM3AP98173 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
FAM3AP98173 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
FAM3AP98173 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
FAM3AP98173 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
FAM3AP98173 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
FAM3AP98173 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
FAM3AP98173 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
FAM3AP98173 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
FAM3AP98173 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
FAM3AP98173 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
FAM3AP98173 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
FAM3AP98173 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
FAM3AP98173 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
FAM3AP98173 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
FAM3AP98173 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
FAM3AP98173 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
FAM3AP98173 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
FAM3AP98173 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
FAM3AP98173 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
FAM3AP98173 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
FAM3AP98173 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
FAM3AP98173 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
FAM3AP98173 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
FAM3AP98173 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
FAM3AP98173 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
FAM3AP98173 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
FAM3AP98173 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
FAM3AP98173 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
FAM3AP98173 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
FAM3AP98173 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
FAM3AP98173 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
FAM3AP98173 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
FAM3AP98173 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
FAM3AP98173 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
FAM3AP98173 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
FAM3AP98173 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
FAM3AP98173 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
FAM3AP98173 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
FAM3AP98173 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
FAM3AP98173 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
FAM3AP98173 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
FAM3AP98173 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
FAM3AP98173 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
FAM3AP98173 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
FAM3AP98173 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
FAM3AP98173 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
FAM3AP98173 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
FAM3AP98173 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
FAM3AP98173 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
FAM3AP98173 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
FAM3AP98173 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
FAM3AP98173 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
FAM3AP98173 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
FAM3AP98173 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
FAM3AP98173 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
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