Protein–RNA interactions for Protein: P97762

rp9, Retinitis pigmentosa 9 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
rp9P97762 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
rp9P97762 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
rp9P97762 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
rp9P97762 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
rp9P97762 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
rp9P97762 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
rp9P97762 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
rp9P97762 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
rp9P97762 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
rp9P97762 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
rp9P97762 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
rp9P97762 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
rp9P97762 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
rp9P97762 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
rp9P97762 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
rp9P97762 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
rp9P97762 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
rp9P97762 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
rp9P97762 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
rp9P97762 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
rp9P97762 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
rp9P97762 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
rp9P97762 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
rp9P97762 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
rp9P97762 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
rp9P97762 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
rp9P97762 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
rp9P97762 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
rp9P97762 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
rp9P97762 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
rp9P97762 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
rp9P97762 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
rp9P97762 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
rp9P97762 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
rp9P97762 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
rp9P97762 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
rp9P97762 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
rp9P97762 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
rp9P97762 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
rp9P97762 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
rp9P97762 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
rp9P97762 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
rp9P97762 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
rp9P97762 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
rp9P97762 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
rp9P97762 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
rp9P97762 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
rp9P97762 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
rp9P97762 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
rp9P97762 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
rp9P97762 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
rp9P97762 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
rp9P97762 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
rp9P97762 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
rp9P97762 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
rp9P97762 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
rp9P97762 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
rp9P97762 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
rp9P97762 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
rp9P97762 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
rp9P97762 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
rp9P97762 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
rp9P97762 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
rp9P97762 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
rp9P97762 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
rp9P97762 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
rp9P97762 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
rp9P97762 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
rp9P97762 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
rp9P97762 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
rp9P97762 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
rp9P97762 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
rp9P97762 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
rp9P97762 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
rp9P97762 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
rp9P97762 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
rp9P97762 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
rp9P97762 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
rp9P97762 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
rp9P97762 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
rp9P97762 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
rp9P97762 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
rp9P97762 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
rp9P97762 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
rp9P97762 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
rp9P97762 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
rp9P97762 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
rp9P97762 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
rp9P97762 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
rp9P97762 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
rp9P97762 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
rp9P97762 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
rp9P97762 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
rp9P97762 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
rp9P97762 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
rp9P97762 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
rp9P97762 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
rp9P97762 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
rp9P97762 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
rp9P97762 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms