Protein–RNA interactions for Protein: P97473

Tarbp2, RISC-loading complex subunit TARBP2, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tarbp2P97473 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Tarbp2P97473 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tarbp2P97473 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tarbp2P97473 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Tarbp2P97473 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Tarbp2P97473 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tarbp2P97473 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tarbp2P97473 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tarbp2P97473 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tarbp2P97473 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Tarbp2P97473 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tarbp2P97473 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tarbp2P97473 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tarbp2P97473 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tarbp2P97473 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tarbp2P97473 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Tarbp2P97473 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tarbp2P97473 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tarbp2P97473 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tarbp2P97473 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tarbp2P97473 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tarbp2P97473 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tarbp2P97473 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tarbp2P97473 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tarbp2P97473 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tarbp2P97473 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tarbp2P97473 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Tarbp2P97473 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tarbp2P97473 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tarbp2P97473 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tarbp2P97473 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tarbp2P97473 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tarbp2P97473 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tarbp2P97473 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tarbp2P97473 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tarbp2P97473 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tarbp2P97473 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tarbp2P97473 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tarbp2P97473 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tarbp2P97473 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tarbp2P97473 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tarbp2P97473 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tarbp2P97473 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tarbp2P97473 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tarbp2P97473 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tarbp2P97473 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tarbp2P97473 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tarbp2P97473 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tarbp2P97473 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tarbp2P97473 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tarbp2P97473 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tarbp2P97473 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tarbp2P97473 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tarbp2P97473 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Tarbp2P97473 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tarbp2P97473 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tarbp2P97473 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tarbp2P97473 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Tarbp2P97473 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tarbp2P97473 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tarbp2P97473 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tarbp2P97473 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tarbp2P97473 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tarbp2P97473 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tarbp2P97473 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tarbp2P97473 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tarbp2P97473 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tarbp2P97473 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tarbp2P97473 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Tarbp2P97473 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tarbp2P97473 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tarbp2P97473 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tarbp2P97473 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tarbp2P97473 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tarbp2P97473 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tarbp2P97473 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tarbp2P97473 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tarbp2P97473 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tarbp2P97473 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tarbp2P97473 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Tarbp2P97473 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tarbp2P97473 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tarbp2P97473 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tarbp2P97473 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tarbp2P97473 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tarbp2P97473 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Tarbp2P97473 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tarbp2P97473 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tarbp2P97473 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tarbp2P97473 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tarbp2P97473 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tarbp2P97473 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tarbp2P97473 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tarbp2P97473 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Tarbp2P97473 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tarbp2P97473 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tarbp2P97473 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tarbp2P97473 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tarbp2P97473 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tarbp2P97473 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms