Protein–RNA interactions for Protein: P97468

Cmklr1, Chemokine-like receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmklr1P97468 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cmklr1P97468 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Cmklr1P97468 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cmklr1P97468 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cmklr1P97468 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cmklr1P97468 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cmklr1P97468 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Cmklr1P97468 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cmklr1P97468 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cmklr1P97468 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cmklr1P97468 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cmklr1P97468 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cmklr1P97468 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cmklr1P97468 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cmklr1P97468 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cmklr1P97468 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cmklr1P97468 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cmklr1P97468 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cmklr1P97468 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cmklr1P97468 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cmklr1P97468 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cmklr1P97468 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cmklr1P97468 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cmklr1P97468 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cmklr1P97468 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cmklr1P97468 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cmklr1P97468 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cmklr1P97468 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cmklr1P97468 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cmklr1P97468 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cmklr1P97468 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cmklr1P97468 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cmklr1P97468 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cmklr1P97468 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Cmklr1P97468 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cmklr1P97468 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cmklr1P97468 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cmklr1P97468 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Cmklr1P97468 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cmklr1P97468 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cmklr1P97468 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cmklr1P97468 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cmklr1P97468 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cmklr1P97468 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cmklr1P97468 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cmklr1P97468 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cmklr1P97468 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cmklr1P97468 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Cmklr1P97468 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cmklr1P97468 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cmklr1P97468 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cmklr1P97468 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cmklr1P97468 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cmklr1P97468 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cmklr1P97468 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cmklr1P97468 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cmklr1P97468 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cmklr1P97468 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cmklr1P97468 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cmklr1P97468 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cmklr1P97468 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cmklr1P97468 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cmklr1P97468 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cmklr1P97468 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cmklr1P97468 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cmklr1P97468 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cmklr1P97468 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cmklr1P97468 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cmklr1P97468 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cmklr1P97468 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cmklr1P97468 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cmklr1P97468 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cmklr1P97468 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cmklr1P97468 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cmklr1P97468 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cmklr1P97468 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cmklr1P97468 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cmklr1P97468 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cmklr1P97468 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cmklr1P97468 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cmklr1P97468 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cmklr1P97468 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cmklr1P97468 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cmklr1P97468 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cmklr1P97468 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cmklr1P97468 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cmklr1P97468 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cmklr1P97468 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cmklr1P97468 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Cmklr1P97468 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cmklr1P97468 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cmklr1P97468 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cmklr1P97468 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cmklr1P97468 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Cmklr1P97468 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cmklr1P97468 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cmklr1P97468 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cmklr1P97468 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cmklr1P97468 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cmklr1P97468 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms