Protein–RNA interactions for Protein: P97452

Bop1, Ribosome biogenesis protein BOP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bop1P97452 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Bop1P97452 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Bop1P97452 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Bop1P97452 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Bop1P97452 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Bop1P97452 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Bop1P97452 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Bop1P97452 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Bop1P97452 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Bop1P97452 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Bop1P97452 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Bop1P97452 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Bop1P97452 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Bop1P97452 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Bop1P97452 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Bop1P97452 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Bop1P97452 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Bop1P97452 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Bop1P97452 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Bop1P97452 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Bop1P97452 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Bop1P97452 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Bop1P97452 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Bop1P97452 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Bop1P97452 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Bop1P97452 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Bop1P97452 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Bop1P97452 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Bop1P97452 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Bop1P97452 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Bop1P97452 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Bop1P97452 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Bop1P97452 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Bop1P97452 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Bop1P97452 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Bop1P97452 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Bop1P97452 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Bop1P97452 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Bop1P97452 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Bop1P97452 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Bop1P97452 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Bop1P97452 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Bop1P97452 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Bop1P97452 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Bop1P97452 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Bop1P97452 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Bop1P97452 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Bop1P97452 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Bop1P97452 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Bop1P97452 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Bop1P97452 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Bop1P97452 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Bop1P97452 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Bop1P97452 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Bop1P97452 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Bop1P97452 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Bop1P97452 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Bop1P97452 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Bop1P97452 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Bop1P97452 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Bop1P97452 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Bop1P97452 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Bop1P97452 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Bop1P97452 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Bop1P97452 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Bop1P97452 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Bop1P97452 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Bop1P97452 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Bop1P97452 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Bop1P97452 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Bop1P97452 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Bop1P97452 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Bop1P97452 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Bop1P97452 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Bop1P97452 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Bop1P97452 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Bop1P97452 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Bop1P97452 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Bop1P97452 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Bop1P97452 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Bop1P97452 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Bop1P97452 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Bop1P97452 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Bop1P97452 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Bop1P97452 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Bop1P97452 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Bop1P97452 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Bop1P97452 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Bop1P97452 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Bop1P97452 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Bop1P97452 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Bop1P97452 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Bop1P97452 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Bop1P97452 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Bop1P97452 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Bop1P97452 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Bop1P97452 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Bop1P97452 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Bop1P97452 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Bop1P97452 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.3 ms