Protein–RNA interactions for Protein: P80316

Cct5, T-complex protein 1 subunit epsilon, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cct5P80316 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cct5P80316 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cct5P80316 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cct5P80316 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cct5P80316 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Cct5P80316 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Cct5P80316 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Cct5P80316 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cct5P80316 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cct5P80316 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cct5P80316 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cct5P80316 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cct5P80316 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cct5P80316 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cct5P80316 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cct5P80316 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cct5P80316 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cct5P80316 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cct5P80316 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cct5P80316 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cct5P80316 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cct5P80316 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cct5P80316 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cct5P80316 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cct5P80316 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cct5P80316 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cct5P80316 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cct5P80316 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cct5P80316 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cct5P80316 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cct5P80316 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cct5P80316 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cct5P80316 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cct5P80316 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Cct5P80316 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cct5P80316 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cct5P80316 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cct5P80316 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cct5P80316 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cct5P80316 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cct5P80316 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Cct5P80316 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Cct5P80316 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cct5P80316 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cct5P80316 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cct5P80316 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cct5P80316 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cct5P80316 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cct5P80316 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cct5P80316 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cct5P80316 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cct5P80316 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cct5P80316 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cct5P80316 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cct5P80316 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cct5P80316 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Cct5P80316 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cct5P80316 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cct5P80316 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cct5P80316 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cct5P80316 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Cct5P80316 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cct5P80316 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cct5P80316 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Cct5P80316 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Cct5P80316 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cct5P80316 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cct5P80316 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cct5P80316 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cct5P80316 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cct5P80316 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cct5P80316 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cct5P80316 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Cct5P80316 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Cct5P80316 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cct5P80316 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cct5P80316 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Cct5P80316 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cct5P80316 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cct5P80316 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Cct5P80316 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Cct5P80316 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cct5P80316 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cct5P80316 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cct5P80316 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cct5P80316 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cct5P80316 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cct5P80316 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cct5P80316 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cct5P80316 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cct5P80316 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cct5P80316 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cct5P80316 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cct5P80316 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cct5P80316 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cct5P80316 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cct5P80316 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cct5P80316 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cct5P80316 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cct5P80316 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64 ms