Protein–RNA interactions for Protein: P70188

Kifap3, Kinesin-associated protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 793 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kifap3P70188 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Kifap3P70188 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Kifap3P70188 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Kifap3P70188 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Kifap3P70188 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Kifap3P70188 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Kifap3P70188 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Kifap3P70188 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Kifap3P70188 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Kifap3P70188 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Kifap3P70188 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Kifap3P70188 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Kifap3P70188 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Kifap3P70188 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Kifap3P70188 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Kifap3P70188 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Kifap3P70188 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Kifap3P70188 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Kifap3P70188 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Kifap3P70188 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Kifap3P70188 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Kifap3P70188 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Kifap3P70188 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Kifap3P70188 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Kifap3P70188 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Kifap3P70188 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Kifap3P70188 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Kifap3P70188 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Kifap3P70188 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Kifap3P70188 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Kifap3P70188 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Kifap3P70188 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Kifap3P70188 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Kifap3P70188 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Kifap3P70188 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Kifap3P70188 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Kifap3P70188 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Kifap3P70188 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Kifap3P70188 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Kifap3P70188 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Kifap3P70188 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Kifap3P70188 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Kifap3P70188 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Kifap3P70188 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Kifap3P70188 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Kifap3P70188 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Kifap3P70188 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Kifap3P70188 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Kifap3P70188 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Kifap3P70188 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Kifap3P70188 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Kifap3P70188 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Kifap3P70188 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Kifap3P70188 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Kifap3P70188 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Kifap3P70188 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Kifap3P70188 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Kifap3P70188 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Kifap3P70188 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Kifap3P70188 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Kifap3P70188 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Kifap3P70188 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Kifap3P70188 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Kifap3P70188 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Kifap3P70188 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Kifap3P70188 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Kifap3P70188 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Kifap3P70188 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Kifap3P70188 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Kifap3P70188 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Kifap3P70188 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Kifap3P70188 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Kifap3P70188 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Kifap3P70188 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Kifap3P70188 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Kifap3P70188 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Kifap3P70188 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Kifap3P70188 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Kifap3P70188 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Kifap3P70188 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Kifap3P70188 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Kifap3P70188 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Kifap3P70188 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Kifap3P70188 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Kifap3P70188 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Kifap3P70188 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Kifap3P70188 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Kifap3P70188 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Kifap3P70188 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Kifap3P70188 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Kifap3P70188 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Kifap3P70188 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Kifap3P70188 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Kifap3P70188 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Kifap3P70188 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Kifap3P70188 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Kifap3P70188 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Kifap3P70188 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Kifap3P70188 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Kifap3P70188 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.5 ms