Protein–RNA interactions for Protein: P62873

GNB1, Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNB1P62873 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GNB1P62873 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GNB1P62873 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GNB1P62873 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GNB1P62873 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GNB1P62873 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GNB1P62873 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GNB1P62873 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GNB1P62873 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GNB1P62873 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GNB1P62873 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GNB1P62873 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GNB1P62873 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GNB1P62873 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GNB1P62873 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GNB1P62873 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GNB1P62873 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GNB1P62873 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GNB1P62873 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GNB1P62873 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
GNB1P62873 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GNB1P62873 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GNB1P62873 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GNB1P62873 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GNB1P62873 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GNB1P62873 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
GNB1P62873 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
GNB1P62873 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
GNB1P62873 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
GNB1P62873 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GNB1P62873 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GNB1P62873 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GNB1P62873 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GNB1P62873 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GNB1P62873 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GNB1P62873 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GNB1P62873 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GNB1P62873 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GNB1P62873 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GNB1P62873 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GNB1P62873 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GNB1P62873 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GNB1P62873 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GNB1P62873 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GNB1P62873 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GNB1P62873 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GNB1P62873 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GNB1P62873 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GNB1P62873 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GNB1P62873 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GNB1P62873 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GNB1P62873 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GNB1P62873 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GNB1P62873 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GNB1P62873 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GNB1P62873 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GNB1P62873 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GNB1P62873 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GNB1P62873 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GNB1P62873 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GNB1P62873 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GNB1P62873 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GNB1P62873 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GNB1P62873 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GNB1P62873 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GNB1P62873 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GNB1P62873 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GNB1P62873 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
GNB1P62873 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GNB1P62873 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GNB1P62873 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GNB1P62873 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GNB1P62873 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GNB1P62873 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GNB1P62873 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GNB1P62873 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GNB1P62873 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GNB1P62873 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GNB1P62873 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GNB1P62873 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GNB1P62873 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GNB1P62873 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GNB1P62873 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GNB1P62873 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GNB1P62873 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GNB1P62873 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GNB1P62873 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GNB1P62873 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GNB1P62873 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GNB1P62873 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
GNB1P62873 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GNB1P62873 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GNB1P62873 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GNB1P62873 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GNB1P62873 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GNB1P62873 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
GNB1P62873 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GNB1P62873 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GNB1P62873 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GNB1P62873 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms