Protein–RNA interactions for Protein: P62829

RPL23, 60S ribosomal protein L23, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL23P62829 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RPL23P62829 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RPL23P62829 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RPL23P62829 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RPL23P62829 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RPL23P62829 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RPL23P62829 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RPL23P62829 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RPL23P62829 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RPL23P62829 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RPL23P62829 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RPL23P62829 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RPL23P62829 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RPL23P62829 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RPL23P62829 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RPL23P62829 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RPL23P62829 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RPL23P62829 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
RPL23P62829 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RPL23P62829 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RPL23P62829 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RPL23P62829 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RPL23P62829 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
RPL23P62829 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RPL23P62829 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RPL23P62829 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RPL23P62829 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RPL23P62829 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RPL23P62829 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RPL23P62829 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RPL23P62829 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RPL23P62829 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RPL23P62829 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RPL23P62829 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
RPL23P62829 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RPL23P62829 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RPL23P62829 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
RPL23P62829 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RPL23P62829 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RPL23P62829 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RPL23P62829 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RPL23P62829 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RPL23P62829 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RPL23P62829 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RPL23P62829 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RPL23P62829 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RPL23P62829 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RPL23P62829 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RPL23P62829 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RPL23P62829 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RPL23P62829 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RPL23P62829 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RPL23P62829 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RPL23P62829 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RPL23P62829 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RPL23P62829 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RPL23P62829 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RPL23P62829 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RPL23P62829 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RPL23P62829 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RPL23P62829 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RPL23P62829 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RPL23P62829 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RPL23P62829 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RPL23P62829 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RPL23P62829 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
RPL23P62829 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RPL23P62829 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RPL23P62829 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RPL23P62829 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RPL23P62829 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RPL23P62829 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RPL23P62829 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
RPL23P62829 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RPL23P62829 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RPL23P62829 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RPL23P62829 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RPL23P62829 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RPL23P62829 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RPL23P62829 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPL23P62829 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
RPL23P62829 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPL23P62829 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPL23P62829 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPL23P62829 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPL23P62829 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
RPL23P62829 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPL23P62829 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPL23P62829 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPL23P62829 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
RPL23P62829 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPL23P62829 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPL23P62829 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPL23P62829 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPL23P62829 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPL23P62829 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPL23P62829 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPL23P62829 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPL23P62829 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPL23P62829 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms