Protein–RNA interactions for Protein: P61809

Cdk5r1, Cyclin-dependent kinase 5 activator 1, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk5r1P61809 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cdk5r1P61809 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cdk5r1P61809 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cdk5r1P61809 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cdk5r1P61809 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Cdk5r1P61809 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cdk5r1P61809 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cdk5r1P61809 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Cdk5r1P61809 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cdk5r1P61809 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cdk5r1P61809 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cdk5r1P61809 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cdk5r1P61809 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cdk5r1P61809 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cdk5r1P61809 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Cdk5r1P61809 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cdk5r1P61809 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cdk5r1P61809 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cdk5r1P61809 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Cdk5r1P61809 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cdk5r1P61809 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cdk5r1P61809 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Cdk5r1P61809 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cdk5r1P61809 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cdk5r1P61809 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cdk5r1P61809 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cdk5r1P61809 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cdk5r1P61809 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cdk5r1P61809 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cdk5r1P61809 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cdk5r1P61809 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cdk5r1P61809 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cdk5r1P61809 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cdk5r1P61809 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Cdk5r1P61809 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cdk5r1P61809 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cdk5r1P61809 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cdk5r1P61809 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cdk5r1P61809 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cdk5r1P61809 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cdk5r1P61809 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cdk5r1P61809 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cdk5r1P61809 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cdk5r1P61809 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cdk5r1P61809 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cdk5r1P61809 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cdk5r1P61809 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cdk5r1P61809 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cdk5r1P61809 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cdk5r1P61809 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cdk5r1P61809 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cdk5r1P61809 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cdk5r1P61809 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cdk5r1P61809 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cdk5r1P61809 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cdk5r1P61809 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cdk5r1P61809 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cdk5r1P61809 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Cdk5r1P61809 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cdk5r1P61809 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cdk5r1P61809 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cdk5r1P61809 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cdk5r1P61809 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cdk5r1P61809 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cdk5r1P61809 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cdk5r1P61809 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cdk5r1P61809 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cdk5r1P61809 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cdk5r1P61809 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cdk5r1P61809 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cdk5r1P61809 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cdk5r1P61809 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cdk5r1P61809 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cdk5r1P61809 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cdk5r1P61809 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cdk5r1P61809 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cdk5r1P61809 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cdk5r1P61809 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cdk5r1P61809 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cdk5r1P61809 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cdk5r1P61809 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cdk5r1P61809 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cdk5r1P61809 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cdk5r1P61809 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cdk5r1P61809 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cdk5r1P61809 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cdk5r1P61809 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Cdk5r1P61809 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cdk5r1P61809 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cdk5r1P61809 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cdk5r1P61809 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cdk5r1P61809 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cdk5r1P61809 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cdk5r1P61809 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cdk5r1P61809 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cdk5r1P61809 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cdk5r1P61809 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cdk5r1P61809 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cdk5r1P61809 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cdk5r1P61809 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms