Protein–RNA interactions for Protein: P60954

Nol4, Nucleolar protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 483 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nol4P60954 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nol4P60954 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Nol4P60954 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Nol4P60954 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Nol4P60954 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nol4P60954 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nol4P60954 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nol4P60954 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nol4P60954 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nol4P60954 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nol4P60954 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nol4P60954 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nol4P60954 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nol4P60954 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nol4P60954 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nol4P60954 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nol4P60954 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nol4P60954 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nol4P60954 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Nol4P60954 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nol4P60954 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Nol4P60954 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nol4P60954 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nol4P60954 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nol4P60954 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nol4P60954 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nol4P60954 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nol4P60954 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nol4P60954 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nol4P60954 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nol4P60954 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nol4P60954 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nol4P60954 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nol4P60954 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Nol4P60954 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nol4P60954 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Nol4P60954 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nol4P60954 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nol4P60954 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Nol4P60954 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nol4P60954 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nol4P60954 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nol4P60954 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nol4P60954 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nol4P60954 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nol4P60954 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nol4P60954 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nol4P60954 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nol4P60954 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Nol4P60954 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Nol4P60954 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Nol4P60954 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nol4P60954 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nol4P60954 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nol4P60954 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nol4P60954 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Nol4P60954 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nol4P60954 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nol4P60954 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nol4P60954 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nol4P60954 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nol4P60954 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nol4P60954 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nol4P60954 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nol4P60954 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nol4P60954 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nol4P60954 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nol4P60954 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nol4P60954 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nol4P60954 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nol4P60954 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nol4P60954 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nol4P60954 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nol4P60954 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nol4P60954 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nol4P60954 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nol4P60954 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nol4P60954 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nol4P60954 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nol4P60954 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nol4P60954 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nol4P60954 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nol4P60954 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nol4P60954 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nol4P60954 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nol4P60954 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nol4P60954 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nol4P60954 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nol4P60954 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nol4P60954 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nol4P60954 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nol4P60954 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nol4P60954 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nol4P60954 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Nol4P60954 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nol4P60954 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nol4P60954 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nol4P60954 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nol4P60954 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nol4P60954 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms