Protein–RNA interactions for Protein: P57725

Samsn1, SAM domain-containing protein SAMSN-1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samsn1P57725 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Samsn1P57725 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Samsn1P57725 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Samsn1P57725 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Samsn1P57725 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Samsn1P57725 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Samsn1P57725 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Samsn1P57725 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Samsn1P57725 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Samsn1P57725 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Samsn1P57725 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Samsn1P57725 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Samsn1P57725 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Samsn1P57725 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Samsn1P57725 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Samsn1P57725 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Samsn1P57725 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Samsn1P57725 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Samsn1P57725 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Samsn1P57725 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Samsn1P57725 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Samsn1P57725 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Samsn1P57725 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Samsn1P57725 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Samsn1P57725 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Samsn1P57725 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Samsn1P57725 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Samsn1P57725 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Samsn1P57725 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Samsn1P57725 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Samsn1P57725 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Samsn1P57725 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Samsn1P57725 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Samsn1P57725 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Samsn1P57725 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Samsn1P57725 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Samsn1P57725 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Samsn1P57725 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Samsn1P57725 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Samsn1P57725 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Samsn1P57725 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Samsn1P57725 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Samsn1P57725 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Samsn1P57725 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Samsn1P57725 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Samsn1P57725 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Samsn1P57725 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Samsn1P57725 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Samsn1P57725 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Samsn1P57725 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Samsn1P57725 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Samsn1P57725 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Samsn1P57725 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Samsn1P57725 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Samsn1P57725 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Samsn1P57725 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Samsn1P57725 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Samsn1P57725 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Samsn1P57725 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Samsn1P57725 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Samsn1P57725 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Samsn1P57725 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Samsn1P57725 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Samsn1P57725 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Samsn1P57725 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Samsn1P57725 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Samsn1P57725 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Samsn1P57725 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Samsn1P57725 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Samsn1P57725 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Samsn1P57725 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Samsn1P57725 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Samsn1P57725 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Samsn1P57725 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Samsn1P57725 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Samsn1P57725 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Samsn1P57725 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Samsn1P57725 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Samsn1P57725 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Samsn1P57725 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Samsn1P57725 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Samsn1P57725 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Samsn1P57725 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Samsn1P57725 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Samsn1P57725 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Samsn1P57725 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Samsn1P57725 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Samsn1P57725 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Samsn1P57725 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Samsn1P57725 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Samsn1P57725 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Samsn1P57725 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Samsn1P57725 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Samsn1P57725 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Samsn1P57725 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Samsn1P57725 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Samsn1P57725 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Samsn1P57725 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Samsn1P57725 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Samsn1P57725 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms