Protein–RNA interactions for Protein: P53677

AP3M2, AP-3 complex subunit mu-2, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3M2P53677 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
AP3M2P53677 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
AP3M2P53677 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
AP3M2P53677 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
AP3M2P53677 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
AP3M2P53677 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
AP3M2P53677 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
AP3M2P53677 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
AP3M2P53677 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
AP3M2P53677 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
AP3M2P53677 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
AP3M2P53677 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
AP3M2P53677 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
AP3M2P53677 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
AP3M2P53677 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
AP3M2P53677 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
AP3M2P53677 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
AP3M2P53677 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
AP3M2P53677 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
AP3M2P53677 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
AP3M2P53677 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
AP3M2P53677 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
AP3M2P53677 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
AP3M2P53677 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
AP3M2P53677 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
AP3M2P53677 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
AP3M2P53677 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
AP3M2P53677 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
AP3M2P53677 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
AP3M2P53677 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
AP3M2P53677 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
AP3M2P53677 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
AP3M2P53677 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
AP3M2P53677 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
AP3M2P53677 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
AP3M2P53677 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
AP3M2P53677 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
AP3M2P53677 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
AP3M2P53677 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
AP3M2P53677 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
AP3M2P53677 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
AP3M2P53677 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
AP3M2P53677 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
AP3M2P53677 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
AP3M2P53677 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
AP3M2P53677 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
AP3M2P53677 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
AP3M2P53677 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
AP3M2P53677 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
AP3M2P53677 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
AP3M2P53677 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
AP3M2P53677 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
AP3M2P53677 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
AP3M2P53677 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
AP3M2P53677 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
AP3M2P53677 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
AP3M2P53677 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
AP3M2P53677 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
AP3M2P53677 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
AP3M2P53677 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
AP3M2P53677 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
AP3M2P53677 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
AP3M2P53677 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
AP3M2P53677 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
AP3M2P53677 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
AP3M2P53677 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
AP3M2P53677 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
AP3M2P53677 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
AP3M2P53677 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
AP3M2P53677 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
AP3M2P53677 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
AP3M2P53677 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
AP3M2P53677 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
AP3M2P53677 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
AP3M2P53677 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
AP3M2P53677 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
AP3M2P53677 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
AP3M2P53677 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
AP3M2P53677 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
AP3M2P53677 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
AP3M2P53677 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
AP3M2P53677 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
AP3M2P53677 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
AP3M2P53677 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
AP3M2P53677 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
AP3M2P53677 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
AP3M2P53677 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
AP3M2P53677 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
AP3M2P53677 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
AP3M2P53677 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
AP3M2P53677 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
AP3M2P53677 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
AP3M2P53677 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
AP3M2P53677 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
AP3M2P53677 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
AP3M2P53677 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
AP3M2P53677 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
AP3M2P53677 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
AP3M2P53677 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
AP3M2P53677 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.9 ms