Protein–RNA interactions for Protein: P53673

CRYBA4, Beta-crystallin A4, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRYBA4P53673 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CRYBA4P53673 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CRYBA4P53673 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CRYBA4P53673 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CRYBA4P53673 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CRYBA4P53673 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CRYBA4P53673 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CRYBA4P53673 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CRYBA4P53673 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CRYBA4P53673 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CRYBA4P53673 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CRYBA4P53673 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CRYBA4P53673 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CRYBA4P53673 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CRYBA4P53673 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CRYBA4P53673 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CRYBA4P53673 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CRYBA4P53673 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CRYBA4P53673 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CRYBA4P53673 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CRYBA4P53673 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CRYBA4P53673 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CRYBA4P53673 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CRYBA4P53673 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CRYBA4P53673 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CRYBA4P53673 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CRYBA4P53673 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CRYBA4P53673 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CRYBA4P53673 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CRYBA4P53673 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CRYBA4P53673 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CRYBA4P53673 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CRYBA4P53673 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CRYBA4P53673 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CRYBA4P53673 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CRYBA4P53673 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CRYBA4P53673 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CRYBA4P53673 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CRYBA4P53673 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CRYBA4P53673 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CRYBA4P53673 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CRYBA4P53673 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CRYBA4P53673 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CRYBA4P53673 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CRYBA4P53673 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CRYBA4P53673 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CRYBA4P53673 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CRYBA4P53673 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CRYBA4P53673 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CRYBA4P53673 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CRYBA4P53673 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CRYBA4P53673 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CRYBA4P53673 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CRYBA4P53673 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CRYBA4P53673 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CRYBA4P53673 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CRYBA4P53673 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CRYBA4P53673 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CRYBA4P53673 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CRYBA4P53673 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CRYBA4P53673 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CRYBA4P53673 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CRYBA4P53673 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CRYBA4P53673 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CRYBA4P53673 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CRYBA4P53673 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CRYBA4P53673 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CRYBA4P53673 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CRYBA4P53673 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CRYBA4P53673 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CRYBA4P53673 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CRYBA4P53673 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CRYBA4P53673 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CRYBA4P53673 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CRYBA4P53673 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CRYBA4P53673 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CRYBA4P53673 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CRYBA4P53673 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CRYBA4P53673 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CRYBA4P53673 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CRYBA4P53673 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CRYBA4P53673 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CRYBA4P53673 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CRYBA4P53673 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CRYBA4P53673 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CRYBA4P53673 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CRYBA4P53673 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CRYBA4P53673 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CRYBA4P53673 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CRYBA4P53673 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CRYBA4P53673 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CRYBA4P53673 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CRYBA4P53673 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CRYBA4P53673 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CRYBA4P53673 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CRYBA4P53673 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CRYBA4P53673 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CRYBA4P53673 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CRYBA4P53673 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CRYBA4P53673 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1060.6 ms