Protein–RNA interactions for Protein: P52651

Rhox5, Homeobox protein Rhox5, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox5P52651 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rhox5P52651 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rhox5P52651 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rhox5P52651 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rhox5P52651 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rhox5P52651 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rhox5P52651 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rhox5P52651 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rhox5P52651 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rhox5P52651 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rhox5P52651 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rhox5P52651 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rhox5P52651 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rhox5P52651 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rhox5P52651 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rhox5P52651 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rhox5P52651 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rhox5P52651 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Rhox5P52651 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rhox5P52651 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rhox5P52651 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Rhox5P52651 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rhox5P52651 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rhox5P52651 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rhox5P52651 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rhox5P52651 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rhox5P52651 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rhox5P52651 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rhox5P52651 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rhox5P52651 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Rhox5P52651 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Rhox5P52651 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Rhox5P52651 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rhox5P52651 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Rhox5P52651 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rhox5P52651 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rhox5P52651 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Rhox5P52651 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Rhox5P52651 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rhox5P52651 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rhox5P52651 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rhox5P52651 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rhox5P52651 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rhox5P52651 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rhox5P52651 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Rhox5P52651 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Rhox5P52651 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Rhox5P52651 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Rhox5P52651 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Rhox5P52651 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Rhox5P52651 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Rhox5P52651 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rhox5P52651 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Rhox5P52651 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rhox5P52651 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rhox5P52651 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Rhox5P52651 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rhox5P52651 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Rhox5P52651 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rhox5P52651 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Rhox5P52651 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rhox5P52651 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rhox5P52651 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rhox5P52651 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rhox5P52651 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rhox5P52651 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Rhox5P52651 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Rhox5P52651 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rhox5P52651 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Rhox5P52651 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rhox5P52651 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rhox5P52651 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rhox5P52651 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rhox5P52651 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rhox5P52651 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rhox5P52651 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rhox5P52651 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rhox5P52651 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rhox5P52651 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rhox5P52651 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rhox5P52651 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rhox5P52651 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rhox5P52651 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rhox5P52651 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Rhox5P52651 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rhox5P52651 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rhox5P52651 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rhox5P52651 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rhox5P52651 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Rhox5P52651 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rhox5P52651 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rhox5P52651 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rhox5P52651 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rhox5P52651 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rhox5P52651 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rhox5P52651 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rhox5P52651 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rhox5P52651 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rhox5P52651 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rhox5P52651 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms